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這篇文章將為大家詳細講解有關The Cancer Immunome Atlas數(shù)據(jù)庫有什么用，小編覺得挺實用的，因此分享給大家做個參考，希望大家閱讀完這篇文章后可以有所收獲。
腫瘤免疫療法在多種惡性腫瘤的臨床治療上取得了顯著效果，然而還是存在大部分患者對于免疫療法沒有響應的問題。為了更好的理解腫瘤和免疫細胞相互作用，科學家對來自TCGA和其他幾個大型腫瘤研究項目，共20種實體瘤的NGS數(shù)據(jù)進行分析，對應文章鏈接如下
https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S2211124716317090
為了更好的查看分析結果，將相關數(shù)據(jù)整理成了一個數(shù)據(jù)庫，網址如下
https://tcia.at/
點擊每個腫瘤對應的柱狀圖，可以查看具體的數(shù)據(jù)，以乳腺癌BRCA為例，結果如下
列出了每個腫瘤患者的ID, 性別，年齡等信息，示意如下
點擊患者ID, 可以查看詳細的臨床信息，示意如下
對于基因的表達量，提供了以下3種結果
gene expression boxplots
gene expression heatmaps
survival analysis
結果示意如下
使用qyanTIseq和Cibersort兩款軟件分析腫瘤患者的免疫細胞組分，結果示意如下
分析在某種特定的腫瘤中免疫細胞是否富集，結果示意如下
分析不同腫瘤患者的異質性，結果示意如下
分析腫瘤新抗原，結果示意如下
該數(shù)據(jù)庫不僅可以查看TCGA中不同腫瘤的分析結果，其分析內容也值得我們借鑒，對于腫瘤樣本的NGS數(shù)據(jù)， 可以進行基因表達與生存分析的關聯(lián)分析，可以進行免疫細胞浸潤分析，新抗原預測等分析內容。
關于“The Cancer Immunome Atlas數(shù)據(jù)庫有什么用”這篇文章就分享到這里了，希望以上內容可以對大家有一定的幫助，使各位可以學到更多知識，如果覺得文章不錯，請把它分享出去讓更多的人看到。
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