DiseaseMeth數(shù)據(jù)庫有什么用

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DNA甲基化作為表觀遺傳的一種標(biāo)記，在生長(zhǎng)發(fā)育和疾病發(fā)生過程中扮演著重要角色。隨著大規(guī)模甲基化研究的進(jìn)行，積累了大量疾病相關(guān)的甲基化數(shù)據(jù)，DiseaseMeth就是一個(gè)保存了人類疾病相關(guān)的甲基化信息的數(shù)據(jù)庫。

官網(wǎng)地址如下

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/diseasemeth/

在DiseaseMeth數(shù)據(jù)庫中，甲基化數(shù)據(jù)的類型包括兩大類別

1. 芯片

   
   

   對(duì)于DNA甲基化芯片，除了27K和450K這兩種常見的illuminaDNA甲基化芯片，還有其他定制的芯片，比如illumina GoldenGate Methylation Cancer Panel I。

   
   

2. NGS
   
   

   高通量測(cè)序主要就是包含WGBS和RRBS兩種數(shù)據(jù)。

   
   

詳細(xì)的信息如下：

Array-based主要包括了27K和450K，其中27K為8.6， 450K為9.3；NGS-based主要包括了WGBS和RRBS,WGBS為3.9，RRBS為4.3。

對(duì)于疾病，包含下列7種類型：

1. Cancer

2. Genetic Disorder

3. Metabolic Disorder

4. Autoimmune Disease

5. Neurolobical Disease

6. Imflammation

7. Others

   
   

其中Cancer類型的數(shù)據(jù)最多，詳細(xì)信息如下：

利用這個(gè)數(shù)據(jù)庫，我們可以根據(jù)疾病或者基因檢索相關(guān)信息。以基因DEFB119為例，該基因相關(guān)疾病的檢索結(jié)果如下

從檢索結(jié)果中，我們可以得到該基因相關(guān)的疾病，以及在該疾病中，這個(gè)基因的甲基化水平是上升還是降低。

對(duì)于相關(guān)疾病，還有熱圖數(shù)據(jù)可以下載

通過這個(gè)數(shù)據(jù)庫，我們可以檢索已有的對(duì)于某種疾病或者某個(gè)基因甲基化的研究結(jié)果。

看完了這篇文章，相信你對(duì)“DiseaseMeth數(shù)據(jù)庫有什么用”有了一定的了解，如果想了解更多相關(guān)知識(shí)，歡迎關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道，感謝各位的閱讀！