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EVLncRNAs數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用

發(fā)布時(shí)間：2022-01-17 10:51:55 來(lái)源：億速云 閱讀：141 作者：小新 欄目：大數(shù)據(jù)

這篇文章主要介紹了EVLncRNAs數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用，具有一定借鑒價(jià)值，感興趣的朋友可以參考下，希望大家閱讀完這篇文章之后大有收獲，下面讓小編帶著大家一起了解一下。

在已有的lncRNA數(shù)據(jù)庫(kù)中，包含了兩種類(lèi)型的lncRNA, 一種是實(shí)驗(yàn)手段證實(shí)過(guò)的lncRNA, 另外一種是軟件預(yù)測(cè)出來(lái)的lncRNA,其中軟件預(yù)測(cè)的結(jié)果是存在很多的假陽(yáng)性的。

EVlncRNAs是目前最大的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的lncRNA數(shù)據(jù)庫(kù)，收錄了來(lái)自動(dòng)物，植物，微生物共77個(gè)物種，1543個(gè)lncRNA, 除了染色體位置，外顯子個(gè)數(shù)，長(zhǎng)度等基本信息外，還提供了lncRNA相關(guān)的疾病，lncRNA功能注釋?zhuān)琹ncRNA與其他分子的相互作用等信息，數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)址如下

http://biophy.dzu.edu.cn/EVLncRNAs/

以H19這個(gè)lncRNA為例，包含了以下幾種信息

1. 基本信息

包括lncRNA id, name, 染色體定位，外顯子個(gè)數(shù)，轉(zhuǎn)錄本編號(hào)等基本信息，示意如下

EVLncRNAs數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用

2. lncRNA相關(guān)疾病

通過(guò)整合了lncRNADisease, lnc2Cancer等數(shù)據(jù)庫(kù)以及已經(jīng)發(fā)表的文獻(xiàn)，提供了lncRNA相關(guān)的疾病信息，示意如下

EVLncRNAs數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用

3.  功能注釋

EVLncRNAs數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用

4.  相互作用

包括了lncRNA與miRNA, protein, TF等相互作用信息，示意如下

EVLncRNAs數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用

該數(shù)據(jù)庫(kù)中的信息是免費(fèi)下載的，示意如下

EVLncRNAs數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用


感謝你能夠認(rèn)真閱讀完這篇文章，希望小編分享的“EVLncRNAs數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用”這篇文章對(duì)大家有幫助，同時(shí)也希望大家多多支持億速云，關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道，更多相關(guān)知識(shí)等著你來(lái)學(xué)習(xí)!

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