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LncCeRbase數(shù)據(jù)庫怎么用

發(fā)布時(shí)間：2022-01-17 09:49:00 來源：億速云 閱讀：167 作者：小新 欄目：大數(shù)據(jù)

這篇文章主要為大家展示了“LncCeRbase數(shù)據(jù)庫怎么用”，內(nèi)容簡(jiǎn)而易懂，條理清晰，希望能夠幫助大家解決疑惑，下面讓小編帶領(lǐng)大家一起研究并學(xué)習(xí)一下“LncCeRbase數(shù)據(jù)庫怎么用”這篇文章吧。

lncRNA可以作為miRNA sponge與miRNA發(fā)生相互作用，通過競(jìng)爭(zhēng)性的結(jié)合miRNA, 可以調(diào)控其他基因的表達(dá)量, 發(fā)揮ceRNA的調(diào)控功能。

隨著ceRNA研究的不斷進(jìn)展，相關(guān)文獻(xiàn)越來越多,LncCeRbase數(shù)據(jù)庫收集整理已發(fā)表文獻(xiàn)中人類相關(guān)的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA信息，網(wǎng)址如下

http://lnccerbase.it1004.com/front/

該數(shù)據(jù)庫將ceRNA相關(guān)信息拆分成了以下4種類別

  1. MiRNA

  2. LncRNA

  3. Gene

  4. Disease


根據(jù)任意一種類別，都可以得到相關(guān)的ceRNA信息，示意如下

LncCeRbase數(shù)據(jù)庫怎么用

對(duì)于LncRNA, 提供了RNAcentral數(shù)據(jù)庫的鏈接；對(duì)于miRNA, 提供了mirBase數(shù)據(jù)庫的鏈接；對(duì)于Gene,提供了NCBI數(shù)據(jù)庫的鏈接。

對(duì)于ceRNA，給出了文獻(xiàn)的標(biāo)題，對(duì)應(yīng)的疾病或者組織，發(fā)表期刊，pubmed Id。

通過這個(gè)數(shù)據(jù)庫，我們可以得到lncRNA相關(guān)的ceRNA信息，既可以作為前期研究的一個(gè)調(diào)研，也可以通過別人發(fā)表的ceRNA文獻(xiàn)，參考其中分析ceRNA的思路和策略。

以上是“LncCeRbase數(shù)據(jù)庫怎么用”這篇文章的所有內(nèi)容，感謝各位的閱讀！相信大家都有了一定的了解，希望分享的內(nèi)容對(duì)大家有所幫助，如果還想學(xué)習(xí)更多知識(shí)，歡迎關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道！

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