MethyCancer數(shù)據(jù)庫怎么用

這篇文章主要為大家展示了“MethyCancer數(shù)據(jù)庫怎么用”，內(nèi)容簡而易懂，條理清晰，希望能夠幫助大家解決疑惑，下面讓小編帶領(lǐng)大家一起研究并學(xué)習(xí)一下“MethyCancer數(shù)據(jù)庫怎么用”這篇文章吧。

癌癥作為人類健康的頭號殺手，引起了科研工作者的官方關(guān)注。鑒于DNA甲基化修飾在腫瘤中的重要作用， MethyCancer數(shù)據(jù)庫整合了DNA甲基化數(shù)據(jù)和基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)，將癌癥與相關(guān)的基因聯(lián)系起來，

網(wǎng)址如下

http://methycancer.psych.ac.cn/

在數(shù)據(jù)庫的首頁，有人類染色體的標(biāo)示圖，可以快速的查看每條染色體上相關(guān)的數(shù)據(jù)概況。

MethyCancer中的甲基化數(shù)據(jù)共有5個來源：

1. HEP

2. MethDB

3. UHN

4. Columbia University

5. BIG

對于這5個不同來源的數(shù)據(jù)，劃分成了7種不同的類型

1. Methylation region

2. Methylation content

3. Methylation pattern

4. Methylation profile

5. CpG Island I

6. CpG Island II

7. CpG Island III

具體的定義可以查看官網(wǎng)的詳細(xì)說明。通過這個數(shù)據(jù)庫，我們可以方便的檢索到癌癥相關(guān)的基因。

設(shè)置好檢索條件之后，點(diǎn)擊search 按鈕，就可以看到如下結(jié)果：

點(diǎn)擊對應(yīng)的Cancer Name, 可以看到所有和該癌癥相關(guān)的基因，比如Overview of breast tumors相關(guān)的基因，這些基因就可以作為該癌癥研究對應(yīng)的panel。

在該數(shù)據(jù)庫中，還提供了一個CpG島的預(yù)測工具

輸入一段fasta序列，然后定義好其他的幾個閾值，提交就可以了。

最重要的一點(diǎn)，這個數(shù)據(jù)庫是可以免費(fèi)下載。

以上是“MethyCancer數(shù)據(jù)庫怎么用”這篇文章的所有內(nèi)容，感謝各位的閱讀！相信大家都有了一定的了解，希望分享的內(nèi)容對大家有所幫助，如果還想學(xué)習(xí)更多知識，歡迎關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道！