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今天小編給大家分享一下KEGG數(shù)據(jù)庫pathway相關(guān)數(shù)據(jù)如何下載的相關(guān)知識點，內(nèi)容詳細(xì)，邏輯清晰，相信大部分人都還太了解這方面的知識，所以分享這篇文章給大家參考一下，希望大家閱讀完這篇文章后有所收獲，下面我們一起來了解一下吧。
我們下載KEGG數(shù)據(jù)庫的目的是為了研究目標(biāo)蛋白參與了那些pathway 。 前面我們介紹了KEGG 數(shù)據(jù)庫中蛋白序列的下載方式，現(xiàn)在來介紹一下patyway 相關(guān)數(shù)據(jù)的下載方式。這個主要采用KEGG 的API 進(jìn)行獲取，思路如下：
1. KEGG 有那些pathway ?
訪問的API地址是：
http://rest.kegg.jp/list/pathway
通過該API ，可以獲得所有pathway的列表。
2. pathway 上有那些KO （KEGG 中的ID編號）
訪問的API地址是：
http://rest.kegg.jp/link/ko/map00010
其中map00010 就是對于的pathway 圖的編號，通過遍歷所有的pathway ,就可以kegg 數(shù)據(jù)庫中跟pathway 相關(guān)KO。
3. KO 對應(yīng)的蛋白編號是哪個？
訪問API地址：
http://rest.kegg.jp/link/genes/K00500
其中K00500 就是我們在第二步中獲得的KO， 通過遍歷所有的KO，就可以獲得在KO在不同物種中的基因（蛋白）編號。
通過這3個步驟，我們就可以獲得了從蛋白到pathway, 相關(guān)的對應(yīng)信息，通過該注釋，我們就可以多不同物種的基因進(jìn)行pathway 分析。
以上就是“KEGG數(shù)據(jù)庫pathway相關(guān)數(shù)據(jù)如何下載”這篇文章的所有內(nèi)容，感謝各位的閱讀！相信大家閱讀完這篇文章都有很大的收獲，小編每天都會為大家更新不同的知識，如果還想學(xué)習(xí)更多的知識，請關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道。
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