如何分析KEGG Drug 數(shù)據(jù)庫

今天就跟大家聊聊有關(guān)如何分析KEGG Drug 數(shù)據(jù)庫，可能很多人都不太了解，為了讓大家更加了解，小編給大家總結(jié)了以下內(nèi)容，希望大家根據(jù)這篇文章可以有所收獲。

kegg drug 數(shù)據(jù)庫是一個藥物相關(guān)信息的綜合數(shù)據(jù)庫，包括了在日本，美國，歐洲上市的的藥物。所有在日本上市的藥物，不論處方藥還是非處方藥，包括天然藥物和中藥，都會在Drug 數(shù)據(jù)中有對應(yīng)的記錄；對于在美國和歐洲上市的藥物， 只有一部分處方藥的信息在drug 數(shù)據(jù)庫中有記錄。

根據(jù)化學(xué)結(jié)果和化學(xué)組分的不同，將藥物進(jìn)行區(qū)分 ，酶中藥物 用D number 進(jìn)行標(biāo)識，比如 D014441 ， 是一種作用于慢性粒細(xì)胞白血病的藥物。對于每種藥物，記錄了其通用名，化學(xué)結(jié)構(gòu)，靶標(biāo)基因，相關(guān)的代謝酶，轉(zhuǎn)運蛋白等各種信息，以D014441 為例，來詳細(xì)看下。

在結(jié)構(gòu)相似性和功能相似性的基礎(chǔ)上，建立了KEGG  DGROUP 數(shù)據(jù)庫，對藥物進(jìn)行了分類，每個group 用DG 編號開頭。在DGROUP 數(shù)據(jù)庫中，有兩種類型的group：

1. 第一種下面只包含對應(yīng)的藥物，這些藥物的化學(xué)結(jié)構(gòu)相近， 比如DG00710包含D08066和 D01441 兩種藥物

2. 第二種group還會包含下一級的group,這種其實是按照功能，分成了不同的層級，比如DG01918 同時包含了藥物D10223和group DG01917;

除了KEGG DGROUP 數(shù)據(jù)庫，brite 數(shù)據(jù)庫也有藥物的分類信息，但是分類的標(biāo)準(zhǔn)特別多。

很多的新藥，其實只是在已有藥物的基礎(chǔ)上，保留核心的化學(xué)結(jié)構(gòu)，其他基團(tuán)稍作變化而成的，了解這種化學(xué)結(jié)構(gòu)的變化，可以為我們在藥物開發(fā)領(lǐng)域提供一定的參考。所以kegg 專門在pathway 數(shù)據(jù)庫中，將各種藥物化學(xué)結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)變繪制了對應(yīng)的通路圖，叫做Structure map , 所有是Structure map組成了pathway 數(shù)據(jù)庫中的一大類別，叫做 Drug Development。

map07011 對應(yīng)的圖片如下

1. drug是藥物相關(guān)信息的綜合性數(shù)據(jù)庫，涵蓋了所有在日本上市的藥物以及部分在美國和歐洲上市的處方藥；
2. 根據(jù)化學(xué)結(jié)構(gòu)的不同，對每種藥物進(jìn)行區(qū)分，用D Number 來唯一標(biāo)識每種藥物，在數(shù)據(jù)庫中記錄了藥物的化學(xué)結(jié)構(gòu)，靶標(biāo)基因，代謝相關(guān)的酶等基本信息；
3. 對于藥物的分類，KEGG GROUP 數(shù)據(jù)庫根據(jù)結(jié)構(gòu)和功能的相似性對藥物進(jìn)行分類，brite數(shù)據(jù)庫則提供了更加多的分類標(biāo)準(zhǔn)；
4. 關(guān)于不同藥物間化學(xué)結(jié)構(gòu)的改變，在pathways數(shù)據(jù)庫中專門有一個叫做Drug Development的類別來進(jìn)行記錄；

看完上述內(nèi)容，你們對如何分析KEGG Drug 數(shù)據(jù)庫有進(jìn)一步的了解嗎？如果還想了解更多知識或者相關(guān)內(nèi)容，請關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道，感謝大家的支持。