circad數(shù)據(jù)庫有什么用

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環(huán)狀RNA具有重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)控功能，越來越多的研究表明，環(huán)狀RNA在許多疾病的發(fā)生與發(fā)展中扮演重要角色，circad是一個(gè)疾病相關(guān)的環(huán)狀RNA數(shù)據(jù)庫，網(wǎng)址如下

http://clingen.igib.res.in/circad/

該數(shù)據(jù)庫中，共收錄了122種疾病和相關(guān)的1000個(gè)環(huán)狀RNA,包含了618個(gè)基因，是目前最為全面的疾病相關(guān)的環(huán)狀RNA數(shù)據(jù)庫。

對(duì)于每種疾病，提供了國際疾病分類系統(tǒng)ICD-10對(duì)應(yīng)的編碼，來唯一標(biāo)識(shí)，同時(shí)還提供了對(duì)應(yīng)的文獻(xiàn)，方便研究者查閱和參考。

官網(wǎng)提供了以下多種檢索方式

1. circRNA Name

2. Gene

3. Locus

4. Organism

5. Disease

6. ICD-10

以乳腺癌為例，對(duì)應(yīng)的ICD-10的編碼為C50,檢索結(jié)果如下所示

第一列是環(huán)狀RNA的名字，第二列是別名，第三列是環(huán)狀RNA來源基因的名字，第四列為環(huán)狀RNA的基因組位置，第五列為物種，第六列為疾病對(duì)應(yīng)的ICD-10編碼，第七列為疾病的名稱。

點(diǎn)擊環(huán)狀RNA的名字，可以查看詳細(xì)信息，結(jié)果示意如下

會(huì)給出對(duì)應(yīng)的檢測(cè)方法，參考文獻(xiàn)，以及在患病者中的表達(dá)趨勢(shì)。

目前數(shù)據(jù)庫對(duì)應(yīng)的文獻(xiàn)還沒有正式發(fā)表，發(fā)表之后這數(shù)據(jù)庫就會(huì)公開下載鏈接。

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