ANFD-HLA數(shù)據(jù)庫有什么用

發(fā)布時間：2022-01-17 10:06:01 來源：億速云閱讀：276 作者：小新欄目：大數(shù)據(jù)

這篇文章主要介紹了ANFD-HLA數(shù)據(jù)庫有什么用，具有一定借鑒價值，感興趣的朋友可以參考下，希望大家閱讀完這篇文章之后大有收獲，下面讓小編帶著大家一起了解一下。

在研究SNP時，我們有類似1000G，HapMap, Exac 等數(shù)據(jù)庫，提供了不同人群中的頻率信息。對于HLA的研究而言，也有存儲頻率信息的數(shù)據(jù)庫-ANFD。

官網(wǎng)鏈接如下

http://www.allelefrequencies.net/default.asp

ANFD全稱Allel Frequency Net Database, 存儲了HLA, KIR，Cytokine, MIC 共4種人類基因組中多態(tài)性較高的突變信息，其中記錄了allel, haplotype, genotype 3種格式的信息，最關(guān)鍵的是，提供了在不同人群中的頻率信息。

ANFD-HLA數(shù)據(jù)庫有什么用

1. Allel 在不同人群中的頻率

通過該數(shù)據(jù)庫的檢索功能，可以查詢HLA Allel在不同人群中的頻率分布，網(wǎng)址如下

http://www.allelefrequencies.net/hla6006a.asp

ANFD-HLA數(shù)據(jù)庫有什么用

Locus指定HLA基因座，Population指定人群，然后點擊Search 按鈕即可，上述條件的檢索結(jié)果如下

ANFD-HLA數(shù)據(jù)庫有什么用

2. haplotype 在不同人群中的頻率

由于HLA基因簇的緊密連鎖性，除了單個Allel的頻率外，相關(guān)單倍型的頻率也是需要關(guān)注的。官網(wǎng)也提供了檢索單倍型的功能，網(wǎng)址如下

http://www.allelefrequencies.net/hla6003a.asp

ANFD-HLA數(shù)據(jù)庫有什么用

通過選擇構(gòu)成單倍型的基因組合，然后進行檢索。上述條件的檢索結(jié)果如下

ANFD-HLA數(shù)據(jù)庫有什么用

通過ANFD數(shù)據(jù)庫，我們可以方便的得到HLA的Allel和haplotype在人群中的頻率信息，除此之外，官網(wǎng)還提供了許多其他的功能，有待進一步的學習和使用。

感謝你能夠認真閱讀完這篇文章，希望小編分享的“ANFD-HLA數(shù)據(jù)庫有什么用”這篇文章對大家有幫助，同時也希望大家多多支持億速云，關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道，更多相關(guān)知識等著你來學習!

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ANFD-HLA數(shù)據(jù)庫有什么用

1. Allel 在不同人群中的頻率

2. haplotype 在不同人群中的頻率

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