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這篇文章將為大家詳細講解有關metascape數(shù)據(jù)庫有什么用，文章內容質量較高，因此小編分享給大家做個參考，希望大家閱讀完這篇文章后對相關知識有一定的了解。
metascape數(shù)據(jù)庫富集分析
介紹：生物信息學研究中，獲取基因列表的GO和KEGG富集分析的需求非常常見。目前有許多生物信息學手段或者數(shù)據(jù)庫可以實現(xiàn)基因富集分析，例如DAVID，但它們有些是收費的，有些不易于使用且很少維護。例如DAVID曾經(jīng)有六年的時間（2010-2016）沒有維護數(shù)據(jù)庫，最近的更新也已經(jīng)兩年半了。而Metascape每月更新其相關的40多個數(shù)據(jù)庫，以確保提供最準確的結果。因此Metascape數(shù)據(jù)庫可以作為富集分析的比較好的手段。
step1：粘貼基因列表或者是上傳基因文件
step2：設置物種
Step3：點Express Analysis
默認的Express Analysis會把許多個數(shù)據(jù)庫的信號通路混一起，出現(xiàn)各種冗余。比如說默認把Reactome、KEGG、Hallmark和GO數(shù)據(jù)庫全部一起展示，但是一般我們科研繪圖時會分別展示GO一張圖，以及KEGG一張圖。
因此我們會在custome Analysis里面的enrichment選項中，從下至上，選擇GO相關的數(shù)據(jù)庫，然后勾選pick selective，然后點擊enrichment analysis
關于metascape數(shù)據(jù)庫有什么用就分享到這里了，希望以上內容可以對大家有一定的幫助，可以學到更多知識。如果覺得文章不錯，可以把它分享出去讓更多的人看到。
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