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這篇文章主要介紹LncRNA2Target數(shù)據(jù)庫有什么用，文中介紹的非常詳細，具有一定的參考價值，感興趣的小伙伴們一定要看完！
lncRNA在基因表達調(diào)控中發(fā)揮重要作用，研究lncRNA調(diào)控的靶基因，有兩種研究策略，一種是通過傳統(tǒng)的實驗手段分析lncRNA結合的蛋白質(zhì)，從而確定lncRNA與蛋白編碼基因的相互作用，常用的手段有以下幾種
immunoprecipitation assays
RNA pull down assays
luciferase reported assays
另外一種手段就是通過敲低或者過表達某個lncRNA, 然后檢測處理前后差異表達的基因，將差異表達的基因作為該lncRNA的靶基因, 通過芯片或者高通量測序都可以。
LncRNA2Target數(shù)據(jù)庫收集整理了已經(jīng)發(fā)表的lncRNA靶基因數(shù)據(jù)，最新版本為v2.0, 網(wǎng)址如下
http://123.59.132.21/lncrna2target/index.jsp
涵蓋了人和小鼠中的lncRNA靶基因，通過Browse菜單，可以查看對應的結果，示意如下
通過Search菜單，可以方便的檢索數(shù)據(jù)庫，示意如下
該數(shù)據(jù)庫提供了下載功能，分別提供了傳統(tǒng)實驗和高通量兩種手段分析的lncRNA靶基因文件，對應以下 兩個文件
lncRNA_target_from_low_throughput_experiments.xlsx
lncRNA_target_from_high_throughput_experiments.txt
對于高通量數(shù)據(jù)，還給出了對應的GEO編號，表達譜數(shù)據(jù)和差異分析的結果，示意如下
通過該數(shù)據(jù)庫，不僅可以查詢lncRNA的靶基因信息，還學到了研究lncRNA靶基因的思路。
以上是“LncRNA2Target數(shù)據(jù)庫有什么用”這篇文章的所有內(nèi)容，感謝各位的閱讀！希望分享的內(nèi)容對大家有幫助，更多相關知識，歡迎關注億速云行業(yè)資訊頻道！
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