HMDD數(shù)據(jù)庫有什么用

這篇文章給大家分享的是有關(guān)HMDD數(shù)據(jù)庫有什么用的內(nèi)容。小編覺得挺實(shí)用的，因此分享給大家做個參考，一起跟隨小編過來看看吧。

HMDD是一個手工收集整理的miRNA與疾病相關(guān)聯(lián)的數(shù)據(jù)庫，最新版本為V3.0，網(wǎng)址如下

http://www.cuilab.cn/hmdd

共包含1102個miRNA基因，850種疾病，32281個miRNA與疾病的關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)，對于每個miRNA與疾病之間的關(guān)聯(lián)，都有對應(yīng)的文獻(xiàn)，會給出pubmed ID。

通過Browse功能，可以從miRNA和disease兩個角度出發(fā)，查看該數(shù)據(jù)庫中的內(nèi)容

1. miRNA

hsa-let-7的結(jié)果示意如下

2. disease

Anemia疾病的結(jié)果示意如下

處理miRNA和疾病之間的關(guān)聯(lián)，利用文獻(xiàn)中的數(shù)據(jù)，還整理出了miRNA對應(yīng)的靶基因數(shù)據(jù)，并提供了miRNA-target gene的網(wǎng)絡(luò)圖，既可以分析單個miRNA的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，也支持某種疾病中的miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，示意如下

圖例如下所示

藍(lán)色節(jié)點(diǎn)代表gene, 其他顏色的節(jié)點(diǎn)代表miRNA, 綠色表示該miRNA在患病者中上調(diào)，紅色代表下調(diào)，灰色代表不確定miRNA的表達(dá)趨勢，紅色連線代表負(fù)調(diào)控作用，綠色連線代表正調(diào)控作用。

該數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)是可以免費(fèi)下載的，通過該數(shù)據(jù)庫，我們可以快速得到miRNA和疾病之間的關(guān)聯(lián)。

感謝各位的閱讀！關(guān)于“HMDD數(shù)據(jù)庫有什么用”這篇文章就分享到這里了，希望以上內(nèi)容可以對大家有一定的幫助，讓大家可以學(xué)到更多知識，如果覺得文章不錯，可以把它分享出去讓更多的人看到吧！