溫馨提示×

您好，登錄后才能下訂單哦！

密碼登錄×
登錄注冊(cè)×
其他方式登錄
點(diǎn)擊 登錄注冊(cè) 即表示同意《億速云用戶(hù)服務(wù)條款》

BioGRID數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用

發(fā)布時(shí)間：2022-01-15 15:54:46 來(lái)源：億速云 閱讀：1153 作者：小新 欄目：大數(shù)據(jù)

這篇文章給大家分享的是有關(guān)BioGRID數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用的內(nèi)容。小編覺(jué)得挺實(shí)用的，因此分享給大家做個(gè)參考，一起跟隨小編過(guò)來(lái)看看吧。

BioGRID數(shù)據(jù)庫(kù)是一個(gè)老牌經(jīng)典的蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)，在今年9月份剛剛分布了最新版本3.5.165，該版本從66,164篇文獻(xiàn)中整理出了1,607,037個(gè)蛋白質(zhì)相互作用，28,093個(gè)嵌合體信息以及726,378個(gè)轉(zhuǎn)錄后修飾PTM信息，涵蓋了多個(gè)物種，官網(wǎng)地址如下

https://thebiogrid.org/

通過(guò)官網(wǎng)的檢索功能，可以根據(jù)基因或者蛋白標(biāo)識(shí)符進(jìn)行檢索，示意如下

BioGRID數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用

在檢索頁(yè)面主要分成以下3大部分

1. 基本描述信息

示意結(jié)果如下，包含了蛋白質(zhì)的名稱(chēng)，別名，轉(zhuǎn)錄后修飾，即UBI對(duì)應(yīng)的行，GO注釋信息，和其他數(shù)據(jù)庫(kù)的鏈接

BioGRID數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用

2. 統(tǒng)計(jì)信息

示意如下，統(tǒng)計(jì)每種相互作用類(lèi)型的數(shù)目和比例

BioGRID數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用

3. 詳細(xì)結(jié)果頁(yè)面

示意如下，可以查看Interactors等詳細(xì)信息

BioGRID數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用

通過(guò)Network菜單，可以顯示該蛋白質(zhì)的相互作用網(wǎng)絡(luò)，示意如下
BioGRID數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用

BioGRID數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)是免費(fèi)開(kāi)放下載的，下載鏈接如下

https://downloads.thebiogrid.org/BioGRID

和其他數(shù)據(jù)庫(kù)類(lèi)似，同時(shí)提供了TAB和XML格式供下載。

BioGRID數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用

感謝各位的閱讀！關(guān)于“BioGRID數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用”這篇文章就分享到這里了，希望以上內(nèi)容可以對(duì)大家有一定的幫助，讓大家可以學(xué)到更多知識(shí)，如果覺(jué)得文章不錯(cuò)，可以把它分享出去讓更多的人看到吧！

向AI問(wèn)一下細(xì)節(jié)

免責(zé)聲明：本站發(fā)布的內(nèi)容（圖片、視頻和文字）以原創(chuàng)、轉(zhuǎn)載和分享為主，文章觀點(diǎn)不代表本網(wǎng)站立場(chǎng)，如果涉及侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系站長(zhǎng)郵箱：is@yisu.com進(jìn)行舉報(bào)，并提供相關(guān)證據(jù)，一經(jīng)查實(shí)，將立刻刪除涉嫌侵權(quán)內(nèi)容。

AI
助
手