linux下Circos怎么安裝

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linux下Circos安裝

circos下載地址：http://circos.ca/software/download/circos/

下載后解壓：

tar xvfz circos-0.67-pre4.tgz

然后進(jìn)去circos-0.67-pre4目錄下的bin目錄

cd  circos-0.67-pre4/bin

檢查所需模塊：

./circos -modules
ok       1.26 Carp
ok       0.40 Clone
ok       2.63 Config::General
ok       3.40 Cwd
ok      2.145 Data::Dumper
ok       2.55 Digest::MD5
ok       2.84 File::Basename
ok       3.40 File::Spec::Functions
ok     0.2301 File::Temp

不是ok的都是缺少的perl模塊，需要手動(dòng)安裝。

安裝方法為使用perl CPAN安裝這些perl模塊。命令：

 perl -MCPAN -e shell

出現(xiàn)下面提示符，即可繼續(xù)安裝。

CPAN[1]>

以安裝Clone模塊為例，install命令安裝，如下：

CPAN[1]>install  Clone

提示安裝成功即可安裝下一個(gè)模塊。

如 perl -MCPAN -e shell命令失敗，出現(xiàn)如下情況：

Can't locate CPAN.pm in @INC (@INC
contains: /usr/local/lib64/perl5 /usr/local/share/perl5
/usr/lib64/perl5/vendor_perl /usr/share/perl5/vendor_perl /usr/lib64/perl5
/usr/share/perl5 .).
 
BEGIN failed--compilation aborted.

則需先安裝perl-CPAN，命令如下：

yum install perl-CPAN

注意：

其中GD模塊安裝前需安裝GD作圖庫(kù)，命令為：

yum install gd*

有些模塊安裝可能會(huì)失敗，這時(shí)候可強(qiáng)制安裝：

CPAN[1]>force  install  Clone

所有模塊安裝完后在檢查一遍：

./circos -modules

全部為ok即可。

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