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megacc如何構(gòu)建進(jìn)化樹(shù).mao文件

發(fā)布時(shí)間：2022-03-19 13:41:51 來(lái)源：億速云 閱讀：268 作者：iii 欄目：開(kāi)發(fā)技術(shù)

本篇內(nèi)容介紹了“megacc如何構(gòu)建進(jìn)化樹(shù).mao文件”的有關(guān)知識(shí)，在實(shí)際案例的操作過(guò)程中，不少人都會(huì)遇到這樣的困境，接下來(lái)就讓小編帶領(lǐng)大家學(xué)習(xí)一下如何處理這些情況吧！希望大家仔細(xì)閱讀，能夠?qū)W有所成！

基于linux版megacc構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)命令如下： -a輸入的是構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)的參數(shù) .mao文件 -d輸入的是多序列比對(duì)之后的結(jié)果文件，可以是fasta格式 -o 是輸出路徑 其中一個(gè)重要的文件 也就是參...

基于linux版megacc構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)命令如下：

/biosoft/MEGA/megacc -a .mao -d fasta -o ./

-a輸入的是構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)的參數(shù) .mao文件

-d輸入的是多序列比對(duì)之后的結(jié)果文件，可以是fasta格式

-o 是輸出路徑

其中一個(gè)重要的文件 也就是參數(shù).mao文件的獲取比較困難，蛋白序列、DNA序列以及建樹(shù)基于的模型不同，具體的參數(shù)變換比較多，而linux下無(wú)法直接形成該文件，可以先借助Windows版megacc 先生成該文件。

“megacc如何構(gòu)建進(jìn)化樹(shù).mao文件”的內(nèi)容就介紹到這里了，感謝大家的閱讀。如果想了解更多行業(yè)相關(guān)的知識(shí)可以關(guān)注億速云網(wǎng)站，小編將為大家輸出更多高質(zhì)量的實(shí)用文章！

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