溫馨提示×

溫馨提示×

您好，登錄后才能下訂單哦！

密碼登錄×
登錄注冊×
其他方式登錄
點(diǎn)擊 登錄注冊 即表示同意《億速云用戶服務(wù)條款》

通過GDCRNATools下載TCGA數(shù)據(jù)的時(shí)報(bào)錯(cuò)怎么辦

發(fā)布時(shí)間：2021-12-07 15:00:13 來源：億速云 閱讀：369 作者：iii 欄目：大數(shù)據(jù)

這篇文章主要介紹“通過GDCRNATools下載TCGA數(shù)據(jù)的時(shí)報(bào)錯(cuò)怎么辦”，在日常操作中，相信很多人在通過GDCRNATools下載TCGA數(shù)據(jù)的時(shí)報(bào)錯(cuò)怎么辦問題上存在疑惑，小編查閱了各式資料，整理出簡單好用的操作方法，希望對大家解答”通過GDCRNATools下載TCGA數(shù)據(jù)的時(shí)報(bào)錯(cuò)怎么辦”的疑惑有所幫助！接下來，請跟著小編一起來學(xué)習(xí)吧！

TCGA 數(shù)據(jù)下載

通過GDCRNATools下載TCGA數(shù)據(jù)的時(shí)候出現(xiàn)了以下的報(bào)錯(cuò)：

通過GDCRNATools下載TCGA數(shù)據(jù)的時(shí)報(bào)錯(cuò)怎么辦

gdc-client軟件安裝和配置

  1. 下載軟件地址：https://gdc.cancer.gov/access-data/gdc-data-transfer-tool，根據(jù)自己的操作系統(tǒng)下載對應(yīng)的版本，這里下載Mac版本。

  2. 通過GDCRNATools下載TCGA數(shù)據(jù)的時(shí)報(bào)錯(cuò)怎么辦

  3. 將下載的軟件解壓，并放在一個(gè)自己好找的目錄，例如我放在了Documents/TCGA數(shù)據(jù)下載中

 

下載數(shù)據(jù)

  1. 在GDC官網(wǎng)：https://portal.gdc.cancer.gov 中找到自己所需要的數(shù)據(jù)，比如HNSC的miRNA數(shù)據(jù)。然后下載Manifest到剛剛軟件放置的目錄
  2. 先點(diǎn)擊Exploration，然后在左側(cè)選取需要的癌癥類型和項(xiàng)目，選好后點(diǎn)擊View Files in Repository

通過GDCRNATools下載TCGA數(shù)據(jù)的時(shí)報(bào)錯(cuò)怎么辦

然后就會(huì)跳轉(zhuǎn)到Repository頁面，可以在這里進(jìn)一步篩選所需要的數(shù)據(jù)。選擇好之后點(diǎn)擊Add All Files to Cart， 然后可以在右上角的cart中看到添加了多少個(gè)文件。如果不要下載其他的數(shù)據(jù)了，就可以直接點(diǎn)擊Manifest，下載到Documents/TCGA數(shù)據(jù)下載中。

通過GDCRNATools下載TCGA數(shù)據(jù)的時(shí)報(bào)錯(cuò)怎么辦然后打開終端，在終端輸入     ./gdc-client download -m gdc_manifest.2020-08-11.txt -d ./HNSC/ 就開始下載啦~

到此，關(guān)于“通過GDCRNATools下載TCGA數(shù)據(jù)的時(shí)報(bào)錯(cuò)怎么辦”的學(xué)習(xí)就結(jié)束了，希望能夠解決大家的疑惑。理論與實(shí)踐的搭配能更好的幫助大家學(xué)習(xí)，快去試試吧！若想繼續(xù)學(xué)習(xí)更多相關(guān)知識，請繼續(xù)關(guān)注億速云網(wǎng)站，小編會(huì)繼續(xù)努力為大家?guī)砀鄬?shí)用的文章！

向AI問一下細(xì)節(jié)

免責(zé)聲明：本站發(fā)布的內(nèi)容（圖片、視頻和文字）以原創(chuàng)、轉(zhuǎn)載和分享為主，文章觀點(diǎn)不代表本網(wǎng)站立場，如果涉及侵權(quán)請聯(lián)系站長郵箱：is@yisu.com進(jìn)行舉報(bào)，并提供相關(guān)證據(jù)，一經(jīng)查實(shí)，將立刻刪除涉嫌侵權(quán)內(nèi)容。

AI
助
手