Disease Ontology是一個什么數(shù)據(jù)庫

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Gene Ontology, 簡稱GO, 是最常用的基因功能注釋數(shù)據(jù)庫之一。Disease Ontolog與GO數(shù)據(jù)庫類似，通過參照MeSH, ICD等疾病分類標(biāo)準(zhǔn)，對人類的常見疾病與罕見病進(jìn)行了歸納整理，提供了一個統(tǒng)一的，標(biāo)準(zhǔn)化的疾病分類系統(tǒng)。

官網(wǎng)如下

http://www.disease-ontology.org/

首頁如下所示

通過官網(wǎng)的檢索框可以對數(shù)據(jù)庫中的信息進(jìn)行檢索，也可以通過左側(cè)的導(dǎo)航欄直接進(jìn)行瀏覽，在右側(cè)的頁面會顯示對應(yīng)的結(jié)果信息。以cancer作為關(guān)鍵詞進(jìn)行檢索，結(jié)果示意如下

給出了每個記錄的DOID和名稱，點(diǎn)擊檢索結(jié)果的所在的行，可以查看對應(yīng)的metadata信息，以DOID:162為例，結(jié)果示意如下

通過Visualize可以查看該節(jié)點(diǎn)相關(guān)的節(jié)點(diǎn)信息，示意如下

和Gene Ontolgy類似，Disease ontology簡稱DO, 所有的疾病信息也是采用了一個有向無環(huán)圖的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)，所有數(shù)據(jù)庫中的信息存儲了一個obo文件中供下載，鏈接如下

http://www.disease-ontology.org/downloads/

同時該網(wǎng)站也體用了API, 方便應(yīng)用程序獲取信息，API URL的格式如下

http://www.disease-ontology.org/api/metadata/DOID:4

直接用DOID進(jìn)行查詢，返回結(jié)果是JSON格式的metadata信息。

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