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小編給大家分享一下dbDEMC是一個(gè)什么數(shù)據(jù)庫(kù),相信大部分人都還不怎么了解,因此分享這篇文章給大家參考一下,希望大家閱讀完這篇文章后大有收獲,下面讓我們一起去了解一下吧!
為了探究miRNA在腫瘤發(fā)生與發(fā)展中的角色,有過去的幾十年間,有很多的文章和數(shù)據(jù)陸續(xù)發(fā)表,通過整合公開發(fā)表的數(shù)據(jù),dbDEMC的開發(fā)團(tuán)隊(duì)提供了一個(gè)在線網(wǎng)站,可以方便的查詢?cè)谀撤N腫瘤中特定miRNA的表達(dá)趨勢(shì),網(wǎng)址如下
http://www.picb.ac.cn/dbDEMC/
該數(shù)據(jù)庫(kù)目前收錄了2224個(gè)miRNA, 36種腫瘤,73種腫瘤亞型,209個(gè)miRNA在腫瘤中的表達(dá)譜數(shù)據(jù),示意如下
其中乳腺癌的相關(guān)記錄是最多的,各個(gè)腫瘤比例如下圖所示
通過Search
功能,可以針對(duì)特定的miRNA進(jìn)行檢索,只需要輸入miRNA的ID即可,檢索框示意如下
檢索結(jié)果如下所示,給出了相關(guān)的GEO編號(hào),腫瘤類型,細(xì)胞系,上下調(diào)趨勢(shì)等信息
通過Browse
功能,可以通過腫瘤類型瀏覽相關(guān)記錄,示意如下
結(jié)果以Experiment
為單位進(jìn)行展示,示意如下
勾選最后一列的單選框,通過View miRNAs
按鈕,可以查看具體的miRNA列表。
通過meta-profiling
功能,可以查看miRNA在特定實(shí)驗(yàn)中的表達(dá)譜數(shù)據(jù),結(jié)果以熱圖進(jìn)行展示,示意如下
通過該數(shù)據(jù)庫(kù),可以方便的檢索已有的miRNA在腫瘤領(lǐng)域的相關(guān)研究,不論是前期調(diào)研,還是后期根據(jù)自己的數(shù)據(jù)進(jìn)行驗(yàn)證,都非常的有用。
以上是“dbDEMC是一個(gè)什么數(shù)據(jù)庫(kù)”這篇文章的所有內(nèi)容,感謝各位的閱讀!相信大家都有了一定的了解,希望分享的內(nèi)容對(duì)大家有所幫助,如果還想學(xué)習(xí)更多知識(shí),歡迎關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道!
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