溫馨提示×

溫馨提示×

您好,登錄后才能下訂單哦!

密碼登錄×
登錄注冊×
其他方式登錄
點(diǎn)擊 登錄注冊 即表示同意《億速云用戶服務(wù)條款》

如何使用fastp軟件對fastq文件進(jìn)行剪切

發(fā)布時(shí)間:2022-02-25 15:19:09 來源:億速云 閱讀:626 作者:小新 欄目:開發(fā)技術(shù)

這篇文章主要介紹如何使用fastp軟件對fastq文件進(jìn)行剪切,文中介紹的非常詳細(xì),具有一定的參考價(jià)值,感興趣的小伙伴們一定要看完!

使用fastp軟件對fastq文件進(jìn)行剪切

fastp是一款較新的數(shù)據(jù)質(zhì)控軟件,可以對測序數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。這里介紹如何對fastq文件進(jìn)行剪切。

其命令如下:

fastp --in1 data_yuanshi/Tres_2_1.clean.fq.gz --out1 Tres_2_1.clean.fq.gz --in2 data_yuanshi/Tres_2_2.clean.fq.gz --out2 Tres_2_2.clean.fq.gz  --trim_front1  15  --trim_front2 15  --correction --thread 8

參數(shù):

--in1    read1輸入文件

--out1    read1剪切后輸出文件

--in2    read2輸入文件

--out2    read2剪切后輸出文件

--trim_front1    對read1的頭部剪切

--trim_front2    對read2的頭部剪切

--trim_tail1    對read1的尾部剪切

--trim_tail2    對read2的尾部剪切

--thread    設(shè)置線程數(shù)

以上是“如何使用fastp軟件對fastq文件進(jìn)行剪切”這篇文章的所有內(nèi)容,感謝各位的閱讀!希望分享的內(nèi)容對大家有幫助,更多相關(guān)知識,歡迎關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道!

向AI問一下細(xì)節(jié)

免責(zé)聲明:本站發(fā)布的內(nèi)容(圖片、視頻和文字)以原創(chuàng)、轉(zhuǎn)載和分享為主,文章觀點(diǎn)不代表本網(wǎng)站立場,如果涉及侵權(quán)請聯(lián)系站長郵箱:is@yisu.com進(jìn)行舉報(bào),并提供相關(guān)證據(jù),一經(jīng)查實(shí),將立刻刪除涉嫌侵權(quán)內(nèi)容。

AI