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bioperl如何同時(shí)讀取雙端的fastq文件

發(fā)布時(shí)間:2022-02-23 10:51:07 來源:億速云 閱讀:171 作者:小新 欄目:開發(fā)技術(shù)

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bioperl同時(shí)讀取雙端的fastq文件

bioperl可以讀取fastq文件,對(duì)其進(jìn)行處理,而且一般是雙端的序列,可以同時(shí)讀取兩個(gè)文件,方法如下:

while ( my $obj1=$fq1->next_seq() and my $obj2=$fq2->next_seq() ) {

    my ($id1,$id2)=($obj1->id,$obj2->id);

    ....

}

這樣就可以同時(shí)讀取read1、read2中的對(duì)應(yīng)序列。

以上是“bioperl如何同時(shí)讀取雙端的fastq文件”這篇文章的所有內(nèi)容,感謝各位的閱讀!相信大家都有了一定的了解,希望分享的內(nèi)容對(duì)大家有所幫助,如果還想學(xué)習(xí)更多知識(shí),歡迎關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道!

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