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bioperl同時(shí)讀取雙端的fastq文件
bioperl可以讀取fastq文件,對(duì)其進(jìn)行處理,而且一般是雙端的序列,可以同時(shí)讀取兩個(gè)文件,方法如下:
while ( my $obj1=$fq1->next_seq() and my $obj2=$fq2->next_seq() ) {
my ($id1,$id2)=($obj1->id,$obj2->id);
....
}
這樣就可以同時(shí)讀取read1、read2中的對(duì)應(yīng)序列。
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