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這篇“samtools過濾多重比對reads的方法”文章的知識點大部分人都不太理解，所以小編給大家總結了以下內(nèi)容，內(nèi)容詳細，步驟清晰，具有一定的借鑒價值，希望大家閱讀完這篇文章能有所收獲，下面我們一起來看看這篇“samtools過濾多重比對reads的方法”文章吧。
samtools過濾多重比對reads的命令如下：
samtools view -h -q 1 -F 4 -F 256 big.sort.dedup.bam |grep -v XA:Z |grep -v SA:Z |samtools view -b - > big.sort.dedup.unique.bam
其中參數(shù)：
-q 1：過濾掉比對質(zhì)量小于1的reads；
-F 4：過濾掉沒有比對上的reads；
-F 256：過濾掉比對上的多次的reads。
以上就是關于“samtools過濾多重比對reads的方法”這篇文章的內(nèi)容，相信大家都有了一定的了解，希望小編分享的內(nèi)容對大家有幫助，若想了解更多相關的知識內(nèi)容，請關注億速云行業(yè)資訊頻道。
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