R語言怎么處理大數(shù)據(jù)時(shí)內(nèi)存out of memory的問題

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R處理大數(shù)據(jù)時(shí)偶爾會(huì)出現(xiàn)out of memory的問題，相關(guān)解決方法：

1、memory.size()查看當(dāng)前work space內(nèi)存使用狀況（MB）

2、memory.limit()查看當(dāng)前work space運(yùn)行使用內(nèi)存的上限

> memory.size()
[1] 94.2
> memory.limit()
[1] 8081

3、ls() 查看當(dāng)前work space的變量

4、利用object.size()查看前一步返回結(jié)果中涉及的變量所占內(nèi)存

> ls()
 [1] "aa"          "age"         "bb"          "diabetes"    "expression"  "geneID"      "n"           "patientData"
 [9] "patientID"   "sample1"     "sample2"     "sample3"     "status"     
> object.size(geneID)
88 bytes

5、rm()刪除一些不需要的變量（使用gc()進(jìn)行Garbage collection）

> rm(geneID)
> rm(patientData)
> rm(patientID)
> rm(age)
> gc()
          used (Mb) gc trigger (Mb) max used (Mb)
Ncells  999611 53.4    1770749 94.6  1442291 77.1
Vcells 1996363 15.3    3142662 24.0  2550980 19.5

6、memory.limit(Limit)，如果提高內(nèi)存使用上限

> memory.limit(100000)
[1] 1e+05
> memory.limit()
[1] 1e+05
>

到此，關(guān)于“R語言怎么處理大數(shù)據(jù)時(shí)內(nèi)存out of memory的問題”的學(xué)習(xí)就結(jié)束了，希望能夠解決大家的疑惑。理論與實(shí)踐的搭配能更好的幫助大家學(xué)習(xí)，快去試試吧！若想繼續(xù)學(xué)習(xí)更多相關(guān)知識(shí)，請(qǐng)繼續(xù)關(guān)注億速云網(wǎng)站，小編會(huì)繼續(xù)努力為大家?guī)砀鄬?shí)用的文章！