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GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數(shù)據(jù)庫(kù)

發(fā)布時(shí)間：2021-12-02 09:31:23 來源：億速云 閱讀：208 作者：柒染 欄目：大數(shù)據(jù)

本篇文章為大家展示了GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數(shù)據(jù)庫(kù)，內(nèi)容簡(jiǎn)明扼要并且容易理解，絕對(duì)能使你眼前一亮，通過這篇文章的詳細(xì)介紹希望你能有所收獲。

GOA全稱Gene Ontology Annotation, 是EMBL-EBI構(gòu)建的一個(gè)GO注釋信息的數(shù)據(jù)庫(kù)。

該數(shù)據(jù)庫(kù)提供了以下3種生物分子的GO注釋信息

  1. 來自UniProtKB數(shù)據(jù)庫(kù)的蛋白

  2. 來自RNACentral數(shù)據(jù)庫(kù)的RNA

  3. 來自Complex數(shù)據(jù)庫(kù)的蛋白復(fù)合物

GOA數(shù)據(jù)庫(kù)的注釋信息不僅包括由Gene Ontology委員會(huì)的專家們提供的手工注釋，還包括由生物信息軟件注釋得到的GO注釋信息。詳細(xì)的來源如下

GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數(shù)據(jù)庫(kù)

GOA的注釋信息可以通過QuickGO進(jìn)行瀏覽，官網(wǎng)上則提供了FTP下載功能，主要包含以下2種文件

1. GO注釋信息

提供了UniProtKB數(shù)據(jù)庫(kù)中蛋白對(duì)應(yīng)的GO注釋信息，同時(shí)對(duì)于常見的物種，還單獨(dú)提供了注釋文件。

GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數(shù)據(jù)庫(kù)

2. Go Mapping 文件

提供了其他數(shù)據(jù)庫(kù)的ID和GO ID之間的對(duì)應(yīng)關(guān)系，列表如下

GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數(shù)據(jù)庫(kù)

FTP的地址如下

ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/GO/goa

GOA的注釋信息通過QuickGO進(jìn)行瀏覽和檢索，通過FTP服務(wù)則可以下載對(duì)應(yīng)的原始注釋信息。

上述內(nèi)容就是GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數(shù)據(jù)庫(kù)，你們學(xué)到知識(shí)或技能了嗎？如果還想學(xué)到更多技能或者豐富自己的知識(shí)儲(chǔ)備，歡迎關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道。

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