R語言指定列取交集后合并多個數(shù)據集的簡便方法是怎樣的

發(fā)布時間：2021-11-22 15:00:04 來源：億速云閱讀：663 作者：柒染欄目：大數(shù)據

今天就跟大家聊聊有關R語言指定列取交集后合并多個數(shù)據集的簡便方法是怎樣的，可能很多人都不太了解，為了讓大家更加了解，小編給大家總結了以下內容，希望大家根據這篇文章可以有所收獲。

之前錄制過一期視頻介紹過這個內容，他的基本需求就是：他有5份數(shù)據集，每一份數(shù)據集都是每行是一個基因，每列是一個樣本，值是對應這個基因的表達量。他想將5個數(shù)據集中的共有基因找出來，然后5個數(shù)據集按共有的基因合并。

我的思路是

那期內容有人留言了簡便方法，很短的代碼就實現(xiàn)了這個目的。我將代碼記錄在這篇推文里

因為5份數(shù)據集以csv格式存儲，首先就是獲得存儲路徑下所有的csv格式文件的文件名，用到的命令是

files<-dir(path = "example_data/merge_data/",
           full.names = T,
           pattern = ".csv")

用到的函數(shù)是dir()

path參數(shù)是數(shù)據文件存儲的路徑

full.names參數(shù)如果設置為TRUE，則返回文件的完整路徑，如果設置的為FALSE則只返回文件名。

相對路徑和絕對路徑是很重要的概念，這個一定要搞明白

pattern參數(shù)指定文件的后綴名

接下來批量將5份數(shù)據讀入

需要借助tidyverse這個包，用到的是map()函數(shù)

library(tidyverse)
df<-map(files,read.csv)
class(df)

df是一個列表，5份數(shù)據分別以數(shù)據框的格式存儲在其中

最后是合并數(shù)據

直接一行命令搞定

df1<-reduce(df,inner_join)

df1就是我們想要的結果

達成這個目的最終總共才用到了4行代碼，太方便了。

之前和一位同學討論的時候他也提到了tidyverse整理數(shù)據，但是自己平時用到的數(shù)據格式還算整齊，基本上用數(shù)據框的一些基本操作就可以達到目的了。也就沒有學tidyverse這個包的內容，看來得抽時間好好學習一下了。

看完上述內容，你們對R語言指定列取交集后合并多個數(shù)據集的簡便方法是怎樣的有進一步的了解嗎？如果還想了解更多知識或者相關內容，請關注億速云行業(yè)資訊頻道，感謝大家的支持。

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