Python怎么調(diào)用R語言

這篇文章給大家分享的是有關(guān)Python怎么調(diào)用R語言的內(nèi)容。小編覺得挺實(shí)用的，因此分享給大家做個參考，一起跟隨小編過來看看吧。

rpy2是Python調(diào)用R程序的模塊，旨在方便Python調(diào)用R中的相關(guān)函數(shù)，而不需要先將數(shù)據(jù)寫入txt再傳給R來分析，從而可以做到全流程自動化。在pandas 0.18的模塊中也添加了rpy2的支持，進(jìn)而更方便溝通了Python和R的數(shù)據(jù)流轉(zhuǎn)，構(gòu)建數(shù)據(jù)分析的生態(tài)系統(tǒng)。

rpy2的安裝還是比較麻煩的，試了很多方法，百度了很多網(wǎng)頁最終安裝成功，做些筆記備忘。

我的安裝環(huán)境是：

• win7_64bit

• python3.5_64位，使用的是Anaconda發(fā)行版。Anaconda發(fā)行版集成了很多Python的有用的數(shù)據(jù)分析模塊，其使用界面和MATLAB很相似，用起來很方便，而且還很方便虛擬出不同版本的Python環(huán)境，對那些既想用python2.7，又想用python3.x的同學(xué)來說是很好的選擇。

• R使用的是Revolution R Open 3.2.3_64bit，這是Revolution R現(xiàn)在已經(jīng)被微軟收購了，改為MRO。MRO和CRAN的R沒有什么區(qū)別，只是改進(jìn)了多進(jìn)程并行計(jì)算的性能，比原生的R確實(shí)有一定的性能提升。當(dāng)然需要MRO網(wǎng)站上對應(yīng)的數(shù)學(xué)計(jì)算庫Math Library，這個在Revolution R Open的下載界面有。1.下載并安裝MRO

1.下載并安裝MRO

安裝對應(yīng)的并行數(shù)學(xué)計(jì)算庫（可選）。下載地址是：
https://mran.revolutionanalytics.com/download/

2.下載安裝Anaconda

下載地址是：
https://www.continuum.io/downloads

3.配置R的環(huán)境變量

這是比較重要的一般，很多安裝失敗的原因就是沒有很好配置環(huán)境變量。
1. 將R目錄添加至path環(huán)境變量
path：D:\Program Files\Microsoft\MRO\R-3.2.3\bin\x64;
2. 將R.dll添加至path環(huán)境變量
path：D:\Program Files\Microsoft\MRO\R-3.2.3\bin\x64\R.dll;
3. 設(shè)置R_HOME環(huán)境變量
R_HOME：D:\Program Files\Microsoft\MRO\R-3.2.3
4. 設(shè)置R_USER環(huán)境變量
R_USER：Administrator
R_USER就是你電腦的用戶名，如果沒有設(shè)置過用戶名就是Administrator，可以通過cmd命令行輸入net user查看。

4.下載非官方版本的rpy2

為什么要下載非官方版本的rpy2我也不知道，反正我使用pip install ryp2沒有成功，缺少對應(yīng)的編譯環(huán)境，百度出來的網(wǎng)頁很多都是說使用非官方版本的rpy2.
下載地址是：http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/ 這是python下包的專用地址
需要下載版本和平臺都相對應(yīng)的whl包，我下的是rpy2-2.9.4-cp36-cp36m-win_amd64.whl，然后使用pip install rpy2-2.9.4-cp36-cp36m-win_amd64.whl安裝即可。

5.python調(diào)用R

參考讓R與Python共舞和python中調(diào)用R

import rpy2.robjects as robjects
# 此時，有三種方法調(diào)用R對象
# 第一種
robjects.r['pi']
# 第二種
robjects.r('pi')
# 這種方法從某種程度上講是萬能的，因?yàn)榭梢詫⑷我獯笮『烷L度的R代碼寫成一個python字符串，之后通過robjects.r('Rcode')調(diào)用執(zhí)行
第三種
robjects.r.pi
# 這種方法對于名稱中有“點(diǎn)號”的變量會出問題，比如data.frame/read.csv等，所以推薦使用第一種方法

# creat an R function
robjects.r('''
   f <- function(r){pi * r}
   ''')
robjects.r['f'](3)

# internal function in R
robjects.r['ls']()

# another internal function
l = robjects.r['letters']
len(l)
robjects.r['paste'](l, collapse = '-')

# an alternative way of getting 'paste' function in R
# eval the R code
coder = 'paste(%s, collapse = "-")' % (l.r_repr())
robjects.r(coder)

6.pandas調(diào)用R

具體參考pandas官方文檔–rpy2 / R interface

7.pandas和R的函數(shù)對比

具體參考pandas官方文檔–Comparison with R / R libraries
列出了實(shí)現(xiàn)相同功能的pandas和R的代碼，很有啟發(fā)性。
同時也說明，有想法，用什么工具實(shí)現(xiàn)都無所謂，糾結(jié)要選python還是R確實(shí)是舍本逐末了。如果時間不夠，精通其中的一門語言，另一門語言能夠掌握簡單的使用，也就夠了。

以后有事時間再詳細(xì)寫寫pandas調(diào)用R的部分，以它們之間數(shù)據(jù)來回傳輸?shù)脑砗妥⒁馐马?xiàng)。

我把下載的包放到了d盤的programdata

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