Linux下Ovito的教程資源有哪些

小樊
82
2024-08-28 21:55:04

Ovito是一款功能強(qiáng)大的原子和分子可視化及分析軟件，它支持多種粒子模擬數(shù)據(jù)的可視化與分析。以下是在Linux下使用Ovito的相關(guān)教程和資源：

Linux下Ovito的安裝教程

  • 安裝OVITO的Python模塊：首先，申請(qǐng)計(jì)算資源并加載miniconda3。然后，創(chuàng)建一個(gè)新的Python環(huán)境，并安裝ovito。具體步驟包括：
    • srun -n 4 -p cpu --pty /bin/bash：申請(qǐng)計(jì)算資源。
    • module load miniconda3：加載miniconda3。
    • source activate ovito：激活ovito環(huán)境。
    • conda create -n ovito python=3.8.18：創(chuàng)建新的Python環(huán)境。
    • conda install --strict-channel-priority -c https://conda.ovito.org -c conda-forge ovito=3.9.4：安裝ovito。
  • 運(yùn)行OVITO的Python模塊：在激活的ovito環(huán)境中，可以通過命令行運(yùn)行ovito腳本。例如：
    • ovitos --nthreads 40 test.py：使用40線程運(yùn)行ovito腳本。

Linux下Ovito的使用教程

  • 基本操作：包括如何導(dǎo)入數(shù)據(jù)圖，使用Expression selection和Invert selection模塊進(jìn)行數(shù)據(jù)處理，以及導(dǎo)出數(shù)據(jù)等步驟。
  • 并行使用：在Linux下，Ovito可以通過命令行方式實(shí)現(xiàn)并行計(jì)算，提高數(shù)據(jù)處理效率。例如，使用ovitos --nthreads 40 test.py命令可以指定40個(gè)線程進(jìn)行計(jì)算。
  • 空間平均作圖：如何利用Ovito實(shí)現(xiàn)空間平均法，繪制更均勻漂亮的原子云圖。

Ovito的官方資源和支持服務(wù)

  • 官方文檔：OVITO的官方文檔提供了軟件的介紹、安裝指南、使用教程等詳細(xì)信息。
  • 支持服務(wù)：OVITO提供一對(duì)一的郵件和視頻聊天支持，以及個(gè)性化的培訓(xùn)服務(wù)，幫助用戶更好地利用軟件。

希望這些資源能幫助您更好地在Linux下使用Ovito。如果您在使用過程中遇到任何問題，不妨聯(lián)系Ovito的官方支持團(tuán)隊(duì)獲取幫助。

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