Perl如何提取染色體序列指定范圍的基因序列

發(fā)布時(shí)間：2022-02-23 10:59:17 來(lái)源：億速云閱讀：222 作者：小新欄目：開(kāi)發(fā)技術(shù)

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Perl提取指定位置的基因序列用到 substr 函數(shù)，用法：

$gene = substr( $fasta,$start-1, $end - $start+1);

其中$fasta是總的序列；$start是提取序列的開(kāi)始位置，由于Perl字符串是從0計(jì)數(shù)的，所以要減1；$end是提取序列的結(jié)束位置；$gene是提取的指定位置的序列。

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