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本篇內容介紹了“TCGAbiolinks錯誤Error in value[[3L]](cond)怎么解決”的有關知識，在實際案例的操作過程中，不少人都會遇到這樣的困境，接下來就讓小編帶領大家學習一下如何處理這些情況吧！希望大家仔細閱讀，能夠學有所成！
在采用TCGAbiolinks 下載TCGA數(shù)據(jù)時，有時候會出現(xiàn)“Error in value[[3L]](cond) : GDC server down, try to use this package later”的錯誤。
這個錯誤一般不會出現(xiàn)，除非GDC的網(wǎng)站有問題，檢測方法有兩種：
1. 在R中運行如下命令：
> GenomicDataCommons::status() Error in curl::curl_fetch_memory(url, handle = handle) : SSL certificate problem: Invalid certificate chain
從返回的信息看，是由于GDC網(wǎng)站的證書有問題。
2. 直接訪問GDC的API站點，查看狀態(tài)信息
遇到這樣的問題，只能采用GDC的頁面和數(shù)據(jù)下載工具 進行數(shù)據(jù)下載。
解決方案：
安裝最新版本的TCGAbiolinks 即可：
# 先安裝devtools包
install.packages("devtools")
devtools::install_github("BioinformaticsFMRP/TCGAbiolinks")“TCGAbiolinks錯誤Error in value[[3L]](cond)怎么解決”的內容就介紹到這里了，感謝大家的閱讀。如果想了解更多行業(yè)相關的知識可以關注億速云網(wǎng)站，小編將為大家輸出更多高質量的實用文章！
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