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本篇內(nèi)容介紹了“怎么用R語(yǔ)言統(tǒng)計(jì)相同ID出現(xiàn)的頻率”的有關(guān)知識(shí),在實(shí)際案例的操作過(guò)程中,不少人都會(huì)遇到這樣的困境,接下來(lái)就讓小編帶領(lǐng)大家學(xué)習(xí)一下如何處理這些情況吧!希望大家仔細(xì)閱讀,能夠?qū)W有所成!
R語(yǔ)言代碼,統(tǒng)計(jì)向量的頻次,其實(shí)很簡(jiǎn)單,用table方法一步就完成,后面就是繪圖了:
注意本代碼的主題為cowplot主題適合SCI文章發(fā)表,并設(shè)置了柱狀圖上加數(shù)字。
library(reshape2) local({r <- getOption("repos") ;r["CRAN"] <- "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/" ;options(repos=r)}) library(ggplot2) library(cowplot) library(RColorBrewer) pairjoin <- function(x){ ran=x ran[length(ran)]=">=11" ran=ran[-1] ran } #統(tǒng)計(jì)頻率,并把大于11的 歸類到一起: data=table(data) data[data>10]=11 MassStatN <- with(hist(data, breaks=seq(0, 11, by = 1), plot=FALSE), data.frame(N=counts, Mass=pairjoin(breaks), PCT=counts/sum(counts))) MassStatN MassStatN$Mass=factor(MassStatN$Mass,levels = MassStatN$Mass,order=T) pn=ggplot(data=MassStatN, aes(x=Mass, y=N)) + geom_bar(fill="#4DAF4A",alpha = .9, stat="identity",width=0.8) + geom_text(aes(x=Mass,y=N+20,label=N))+ guides(fill=FALSE)+ theme(legend.key = element_blank(),legend.title = element_blank() )+ xlab("Peptide number")+ylab("Protein number") +ggtitle("Peptide number distribution") pn
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