blast報錯怎么辦

這篇文章將為大家詳細講解有關blast報錯怎么辦，小編覺得挺實用的，因此分享給大家做個參考，希望大家閱讀完這篇文章后可以有所收獲。

在剛開始按官網(wǎng)教程（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279680/）學習使用blast時，經(jīng)常會遇到程序報錯，例如：

直接復制粘貼官網(wǎng)的代碼并執(zhí)行：

makeblastdb –in mydb.fsa –dbtype nucl –parse_seqids

總會有如下錯誤提示：

USAGE
  makeblastdb [-h] [-help] [-in input_file] [-input_type type]
    -dbtype molecule_type [-title database_title] [-parse_seqids]
    [-hash_index] [-mask_data mask_data_files] [-mask_id mask_algo_ids]
    [-mask_desc mask_algo_descriptions] [-gi_mask]
    [-gi_mask_name gi_based_mask_names] [-out database_name]
    [-max_file_sz number_of_bytes] [-logfile File_Name] [-taxid TaxID]
    [-taxid_map TaxIDMapFile] [-version]
DESCRIPTION
   Application to create BLAST databases, version 2.4.0+
Use '-help' to print detailed descriptions of command line arguments
========================================================================
Error: Too many positional arguments (1), the offending value: –in
Error:  (CArgException::eSynopsis) Too many positional arguments (1), the offending value: –in

多次修改嘗試，結果都是如此。直到有一次手動輸入命令時，才沒有報錯。仔細比對才發(fā)現(xiàn)官網(wǎng)命令和手動輸入命令的參數(shù)名稱前面的小橫杠有細微差異（官網(wǎng)：–，手工輸入：-）。所以，只需要修改橫杠即可。

因此不能直接粘貼官網(wǎng)的命令，需要手動修改命令的參數(shù)名稱前面的小橫杠哦~

關于“blast報錯怎么辦”這篇文章就分享到這里了，希望以上內(nèi)容可以對大家有一定的幫助，使各位可以學到更多知識，如果覺得文章不錯，請把它分享出去讓更多的人看到。