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blast批量注釋輸出結(jié)果指定需要的列信息
makeblastdb -in PlantTFDB-all_TF_pep.fas -dbtype prot -title PlantTFDB-all_TF_pep.fas #提取基因列表對應(yīng)的蛋白序列： python $scriptdir/get_fa_by_id.py -i ../7.all_enrich/gene.list \ -f ../7.all_enrich/pep.fa -p query #轉(zhuǎn)錄因子blastp注釋 blastp -query query.fa -db Ath_pep.fas -max_hsps 1 \ -num_alignments 1 -evalue 1e-5 -num_threads 2 \ -outfmt "6 qseqid sseqid qlen slen pident length mismatch gapopen qstart qend sstart send evalue bitscore qcovs stitle"\ -out tf.blast.out
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