R語(yǔ)言是什么

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什么是R語(yǔ)言

R語(yǔ)言是在1991年由新西蘭奧克蘭大學(xué)的Robert Gentleman 和 Ross Ihaka 及其他志愿人員開(kāi)發(fā)的語(yǔ)言系統(tǒng)。因?yàn)檫@兩個(gè)開(kāi)發(fā)者的名字都是以字母R開(kāi)頭，所以就叫做R語(yǔ)言，R是一個(gè)功能強(qiáng)大、用途廣泛的統(tǒng)計(jì)分析、繪圖的語(yǔ)言和操作環(huán)境。

R語(yǔ)言是生信統(tǒng)計(jì)和繪圖的首選

為生物統(tǒng)計(jì)而生的語(yǔ)言
生物數(shù)據(jù)分析當(dāng)中很多地方都需要用到統(tǒng)計(jì)分析，R的開(kāi)發(fā)最初就是要解決生物統(tǒng)計(jì)方面的問(wèn)題，其創(chuàng)始人之一的Robert Gentleman就是一位生物學(xué)家。R是一個(gè)全面的統(tǒng)計(jì)研究平臺(tái)，豐富的數(shù)據(jù)分析工具幾乎可以完成任何類(lèi)型的數(shù)據(jù)分析工作。
比如Bioconductor包，已經(jīng)收錄了包括做轉(zhuǎn)錄組差異分析的常用包DEseq2，edgeR，芯片數(shù)據(jù)分析相關(guān)的limma、affy包等等約2000個(gè)包。當(dāng)然R語(yǔ)言不止只有Bioconductor，還有CRAN也收錄了很多R包。
開(kāi)源免費(fèi)
市面上也有很多其他流行的統(tǒng)計(jì)和繪圖軟件，例如微軟的Excel、SAS，IBM的SPSS、Stata、S-PLUS以及Matlab等。但這些軟件大多是商業(yè)軟件，需要支付高昂的費(fèi)用才能使用，而R語(yǔ)言則是免費(fèi)的。
優(yōu)秀的繪圖功能
數(shù)據(jù)在統(tǒng)計(jì)分析之后，最重要的就是要把結(jié)果可視化的展示出來(lái)，R擁有頂尖的繪圖功能，可以繪制非常專(zhuān)業(yè)精美的圖形，很多頂級(jí)雜志當(dāng)中漂亮的圖都是應(yīng)用R語(yǔ)言繪制的。

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