R語(yǔ)言如何在行上取數(shù)據(jù)子集

本篇內(nèi)容介紹了“R語(yǔ)言如何在行上取數(shù)據(jù)子集”的有關(guān)知識(shí)，在實(shí)際案例的操作過(guò)程中，不少人都會(huì)遇到這樣的困境，接下來(lái)就讓小編帶領(lǐng)大家學(xué)習(xí)一下如何處理這些情況吧！希望大家仔細(xì)閱讀，能夠?qū)W有所成！

subset_row.r  提供列表，在行上取數(shù)據(jù)子集

使用方法：

usage: /share/nas1/huangls/test/TCGA_GEO_immu/scripts/subset_row.r
       [-h] -i input -m idlist -c colname [-o outdir] [-p prefix]
get subset by ID
optional arguments:
  -h, --help            show this help message and exit
  -i input, --input input
                        input data matrix data [required]
  -m idlist, --idlist idlist
                        input idlist [required]
  -c colname, --colname colname
                        match column name in idlist and input [required]
  -o outdir, --outdir outdir
                        output file directory [default cwd]
  -p prefix, --prefix prefix
                        output file name prefix [default demo]

參數(shù)說(shuō)明：

-i 輸入要取子集的數(shù)據(jù)，

-m 指定ID列表，-c 指定 ID列表中的列名：

使用舉例：

Rscript $scriptdir/subset_row.r -m ../04.deg/S1_vs_S2.edger.DEG.final.tsv -c ID \
  -i ../02.sample_select/TCGA-STAD_gene_expression_TPM.tsv -p deg_gene_exp_tpm

“R語(yǔ)言如何在行上取數(shù)據(jù)子集”的內(nèi)容就介紹到這里了，感謝大家的閱讀。如果想了解更多行業(yè)相關(guān)的知識(shí)可以關(guān)注億速云網(wǎng)站，小編將為大家輸出更多高質(zhì)量的實(shí)用文章！