R語言的nomogram_multi_cox.r怎么用

這篇“R語言的nomogram_multi_cox.r怎么用”文章的知識點大部分人都不太理解，所以小編給大家總結(jié)了以下內(nèi)容，內(nèi)容詳細，步驟清晰，具有一定的借鑒價值，希望大家閱讀完這篇文章能有所收獲，下面我們一起來看看這篇“R語言的nomogram_multi_cox.r怎么用”文章吧。

nomogram_multi_cox.r  多因素cox分析構(gòu)建模型并繪制列線圖nomogram

使用說明：

列線圖用的R包rms；

$Rscript $scriptdir/nomogram_multi_cox.r -h
usage: /share/nas1/huangls/test/TCGA_immu/scripts/nomogram_multi_cox.r
       [-h] -i data -t time -e event -v variate [variate ...]
       [-P predict.time [predict.time ...]] [-c cut.score] [-s seed]
       [-o outdir] [-p prefix]
cox regression analysis gene expression
optional arguments:
  -h, --help            show this help message and exit
  -i data, --data data  input data file path[required]
  -t time, --time time  set suvival time column name [required]
  -e event, --event event
                        set event column name must 0 or 1 code format
                        [required]
  -v variate [variate ...], --variate variate [variate ...]
                        variate for cox analysis [required]
  -P predict.time [predict.time ...], --predict.time predict.time [predict.time ...]
                        Time point to draw the ROC curve [default 365 1095
                        1825]
  -c cut.score, --cut.score cut.score
                        set cut score value to divide high and low risk groups
                        [default median]
  -s seed, --seed seed  set random seed [default 2021]
  -o outdir, --outdir outdir
                        output file directory [default cwd]
  -p prefix, --prefix prefix
                        out file name prefix [default cox]

使用舉例:

Rscript $scriptdir/nomogram_multi_cox.r -i nomogram_metadata.tsv -e EVENT -t TIME \
  -v riskScore      ajcc_pathologic_stage       -o multicox.nomogram\
  -p  multicox   -P 365 710 1095

以上就是關(guān)于“R語言的nomogram_multi_cox.r怎么用”這篇文章的內(nèi)容，相信大家都有了一定的了解，希望小編分享的內(nèi)容對大家有幫助，若想了解更多相關(guān)的知識內(nèi)容，請關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道。