pheatmap如何繪制熱圖

這篇文章主要介紹pheatmap如何繪制熱圖，文中介紹的非常詳細(xì)，具有一定的參考價(jià)值，感興趣的小伙伴們一定要看完！

install.package("pheatmap") #安裝包

library(pheatmap) #調(diào)用包

data <- read.table("111.csv",row.names=1,seq="\t")#導(dǎo)入數(shù)據(jù)

pheatmap(data,scale = "column"#安行均一化，“row”，“column”，“none”默認(rèn)是“none”,clustering_distance_rows = "correlation"#聚類線長度優(yōu)化,treeheight_row = 40,#按照行聚類樹高treeheight_col = 40#按列聚類樹高,cluster_cols = FALSE,#是否按列聚類cluster_rows = F,#是否按行聚類display_numbers = F,#是否在每一個(gè)格上顯示數(shù)據(jù)number_format = "%.2f",#顯示數(shù)據(jù)格式，幾位小數(shù)，或“\%1e”，顏色number_color，大小fontsize_number fontsize_row = 10,#行名稱字體大小fontsize_col = 15,#列名稱字體大小cellwidth = 50,cellheight = 14,main="ABC"#標(biāo)題名稱,gaps_row = c(10,15),#插入縫隙，不能聚類cutree_rows = 7,#按聚類分割show_colnames = TRUE#是否顯示列名,color=colorRampPalette(c("green","white","red"),bias=2.5)(256),color=colorRampPalette(c("MediumBlue","white","red"))(256),#定義顏色border_color = "black",#定義格子框的顏色legend = FALSE,#是否顯示圖例legend_breaks = -1:4,#圖例范圍你filename = "111.pdf"#保存文件命令)

以上是“pheatmap如何繪制熱圖”這篇文章的所有內(nèi)容，感謝各位的閱讀！希望分享的內(nèi)容對大家有幫助，更多相關(guān)知識，歡迎關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道！