HLA Epitope Registry-HLA抗原表位數(shù)據(jù)庫有什么用

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抗原表位指的是抗原分子中決定抗原特異性的特殊化學(xué)基因，抗原通過抗原表位與對(duì)應(yīng)的抗原受體想結(jié)合，從而引起免疫應(yīng)答反應(yīng)。一個(gè)抗原分子可以含有多個(gè)抗原表位，抗原表位的性質(zhì)，數(shù)目和空間結(jié)構(gòu)決定了抗原的特異性。

多種抗原分子之間會(huì)存在共有的抗原表位，由這些共同的抗原表位刺激機(jī)體而產(chǎn)生的抗體可以與多種抗原分子相結(jié)合，這種想象叫做交叉反應(yīng)。

采用常規(guī)的血清學(xué)手段對(duì)HLA分型時(shí)，由于交叉反應(yīng)的存在，并不能特異性的鑒定某一種抗原，所以血清學(xué)分型的結(jié)果，對(duì)應(yīng)的是多個(gè)抗原的集合。為了了解HLA抗原的特異性，就必須對(duì)其抗原表位進(jìn)行研究。HLA Epitope Registry 是一個(gè)在線的數(shù)據(jù)庫，存儲(chǔ)了HLA Allel 對(duì)應(yīng)的抗原表位信息。

網(wǎng)址如下:

http://epregistry.ufpi.br/

對(duì)于不同的HLA 基因座，采用了不同的子數(shù)據(jù)庫進(jìn)行存儲(chǔ)，共有以下幾個(gè)子數(shù)據(jù)庫

1. ABC

2. DRB

3. DQB+DQA

4. DPB + DPA

5. MICA

   
   

以ABC為例，該數(shù)據(jù)庫存儲(chǔ)的是HLA-A , HLA-B, HLA-C 這3個(gè)經(jīng)典的HLA I 型基因的抗原表位信息，網(wǎng)址如下

http://epregistry.ufpi.br/index/databases/database/ABC/

第一列是抗原表位的名字，第二列代表該基團(tuán)是否暴露在抗原分子表面，第三列信息和第一列一樣， 第四列表示頻率， 可以連接到ANFD數(shù)據(jù)庫， 第五列表示抗體反應(yīng)，如果存在實(shí)驗(yàn)證據(jù)支持，取值為confirmed,其他則為provisional;  第六列表示抗原表位的結(jié)構(gòu)，第七列表示Luminex 芯片中對(duì)應(yīng)的HLA Allel; 第八列表示抗原表位對(duì)應(yīng)的所有的Allel。

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