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這期內(nèi)容當(dāng)中小編將會給大家?guī)碛嘘P(guān)怎么在Python中利用Pandas處理數(shù)據(jù),文章內(nèi)容豐富且以專業(yè)的角度為大家分析和敘述,閱讀完這篇文章希望大家可以有所收獲。
硬件環(huán)境
CPU:3.5 GHz Intel Core i7
內(nèi)存:32 GB HDDR 3 1600 MHz
硬盤:3 TB Fusion Drive
數(shù)據(jù)分析工具
Python:2.7.6
Pandas:0.15.0
IPython notebook:2.0.0
源數(shù)據(jù)如下表所示:
Table | Size | Desc | |
---|---|---|---|
ServiceLogs | 98,706,832 rows x 14 columns | 8.77 GB | 交易日志數(shù)據(jù),每個交易會話可以有多條交易 |
ServiceCodes | 286 rows × 8 columns | 20 KB | 交易分類的字典表 |
數(shù)據(jù)讀取
啟動IPython notebook,加載pylab環(huán)境:
ipython notebook --pylab=inline
Pandas提供了IO工具可以將大文件分塊讀取,測試了一下性能,完整加載9800萬條數(shù)據(jù)也只需要263秒左右,還是相當(dāng)不錯了。
import pandas as pd reader = pd.read_csv('data/servicelogs', iterator=True) try: df = reader.get_chunk(100000000) except StopIteration: print "Iteration is stopped."
1百萬條 | 1千萬條 | 1億條 | |
---|---|---|---|
ServiceLogs | 1 s | 17 s | 263 s |
使用不同分塊大小來讀取再調(diào)用pandas.concat連接DataFrame,chunkSize設(shè)置在1000萬條左右速度優(yōu)化比較明顯。
loop = True chunkSize = 100000 chunks = [] while loop: try: chunk = reader.get_chunk(chunkSize) chunks.append(chunk) except StopIteration: loop = False print "Iteration is stopped." df = pd.concat(chunks, ignore_index=True)
下面是統(tǒng)計數(shù)據(jù),Read Time是數(shù)據(jù)讀取時間,Total Time是讀取和Pandas進(jìn)行concat操作的時間,根據(jù)數(shù)據(jù)總量來看,對5~50個DataFrame對象進(jìn)行合并,性能表現(xiàn)比較好。
Chunk SizeRead Time (s)Total Time (s)Performance100,000224.418173261.358521200,000232.076794256.6741541,000,000213.128481234.934142√√2,000,000208.410618230.006299√√√5,000,000209.460829230.939319√√√10,000,000207.082081228.135672√√√√20,000,000209.628596230.775713√√√50,000,000222.910643242.405967100,000,000263.574246263.574246
如果使用Spark提供的Python Shell,同樣編寫Pandas加載數(shù)據(jù),時間會短25秒左右,看來Spark對Python的內(nèi)存使用都有優(yōu)化。
數(shù)據(jù)清洗
Pandas提供了DataFrame.describe方法查看數(shù)據(jù)摘要,包括數(shù)據(jù)查看(默認(rèn)共輸出首尾60行數(shù)據(jù))和行列統(tǒng)計。由于源數(shù)據(jù)通常包含一些空值甚至空列,會影響數(shù)據(jù)分析的時間和效率,在預(yù)覽了數(shù)據(jù)摘要后,需要對這些無效數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。
首先調(diào)用DataFrame.isnull()方法查看數(shù)據(jù)表中哪些為空值,與它相反的方法是DataFrame.notnull(),Pandas會將表中所有數(shù)據(jù)進(jìn)行null計算,以True/False作為結(jié)果進(jìn)行填充,如下圖所示:
Pandas的非空計算速度很快,9800萬數(shù)據(jù)也只需要28.7秒。得到初步信息之后,可以對表中空列進(jìn)行移除操作。嘗試了按列名依次計算獲取非空列,和DataFrame.dropna()兩種方式,時間分別為367.0秒和345.3秒,但檢查時發(fā)現(xiàn) dropna() 之后所有的行都沒有了,查了Pandas手冊,原來不加參數(shù)的情況下, dropna() 會移除所有包含空值的行。如果只想移除全部為空值的列,需要加上 axis 和 how 兩個參數(shù):
df.dropna(axis=1, how='all')
共移除了14列中的6列,時間也只消耗了85.9秒。
接下來是處理剩余行中的空值,經(jīng)過測試,在DataFrame.replace()中使用空字符串,要比默認(rèn)的空值NaN節(jié)省一些空間;但對整個CSV文件來說,空列只是多存了一個“,”,所以移除的9800萬 x 6列也只省下了200M的空間。進(jìn)一步的數(shù)據(jù)清洗還是在移除無用數(shù)據(jù)和合并上。
對數(shù)據(jù)列的丟棄,除無效值和需求規(guī)定之外,一些表自身的冗余列也需要在這個環(huán)節(jié)清理,比如說表中的流水號是某兩個字段拼接、類型描述等,通過對這些數(shù)據(jù)的丟棄,新的數(shù)據(jù)文件大小為4.73GB,足足減少了4.04G!
數(shù)據(jù)處理
使用DataFrame.dtypes可以查看每列的數(shù)據(jù)類型,Pandas默認(rèn)可以讀出int和float64,其它的都處理為object,需要轉(zhuǎn)換格式的一般為日期時間。DataFrame.astype()方法可對整個DataFrame或某一列進(jìn)行數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換,支持Python和NumPy的數(shù)據(jù)類型。
df['Name'] = df['Name'].astype(np.datetime64)
對數(shù)據(jù)聚合,我測試了 DataFrame.groupby 和 DataFrame.pivot_table 以及 pandas.merge ,groupby 9800萬行 x 3列的時間為99秒,連接表為26秒,生成透視表的速度更快,僅需5秒。
df.groupby(['NO','TIME','SVID']).count() # 分組 fullData = pd.merge(df, trancodeData)[['NO','SVID','TIME','CLASS','TYPE']] # 連接 actions = fullData.pivot_table('SVID', columns='TYPE', aggfunc='count') # 透視表
根據(jù)透視表生成的交易/查詢比例餅圖:
將日志時間加入透視表并輸出每天的交易/查詢比例圖:
total_actions = fullData.pivot_table('SVID', index='TIME', columns='TYPE', aggfunc='count') total_actions.plot(subplots=False, figsize=(18,6), kind='area')
除此之外,Pandas提供的DataFrame查詢統(tǒng)計功能速度表現(xiàn)也非常優(yōu)秀,7秒以內(nèi)就可以查詢生成所有類型為交易的數(shù)據(jù)子表:
tranData = fullData[fullData['Type'] == 'Transaction']
該子表的大小為[10250666 rows x 5 columns]。在此已經(jīng)完成了數(shù)據(jù)處理的一些基本場景。實驗結(jié)果足以說明,在非“>5TB”數(shù)據(jù)的情況下,Python的表現(xiàn)已經(jīng)能讓擅長使用統(tǒng)計分析語言的數(shù)據(jù)分析師游刃有余。
上述就是小編為大家分享的怎么在Python中利用Pandas處理數(shù)據(jù)了,如果剛好有類似的疑惑,不妨參照上述分析進(jìn)行理解。如果想知道更多相關(guān)知識,歡迎關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道。
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