怎么在python中將nii文件批量轉(zhuǎn)換成png圖像

這篇文章主要為大家詳細(xì)介紹了怎么在python中將nii文件批量轉(zhuǎn)換成png圖像，文中示例代碼介紹的非常詳細(xì)，具有一定的參考價(jià)值，發(fā)現(xiàn)的小伙伴們可以參考一下：

Python主要用來(lái)做什么

Python主要應(yīng)用于：1、Web開(kāi)發(fā)；2、數(shù)據(jù)科學(xué)研究；3、網(wǎng)絡(luò)爬蟲(chóng)；4、嵌入式應(yīng)用開(kāi)發(fā)；5、游戲開(kāi)發(fā)；6、桌面應(yīng)用開(kāi)發(fā)。

import numpy as np
import os    #遍歷文件夾
import nibabel as nib #nii格式一般都會(huì)用到這個(gè)包
import imageio   #轉(zhuǎn)換成圖像
 
def nii_to_image(niifile):
 filenames = os.listdir(filepath) #讀取nii文件夾
 slice_trans = []
 
 for f in filenames:
  #開(kāi)始讀取nii文件
  img_path = os.path.join(filepath, f)
  img = nib.load(img_path)    #讀取nii
  img_fdata = img.get_fdata()
  fname = f.replace('.nii','')   #去掉nii的后綴名
  img_f_path = os.path.join(imgfile, fname)
  #創(chuàng)建nii對(duì)應(yīng)的圖像的文件夾
  if not os.path.exists(img_f_path):
   os.mkdir(img_f_path)    #新建文件夾
 
  #開(kāi)始轉(zhuǎn)換為圖像
  (x,y,z) = img.shape
  for i in range(z):      #z是圖像的序列
   silce = img_fdata[i, :, :]   #選擇哪個(gè)方向的切片都可以
   imageio.imwrite(os.path.join(img_f_path,'{}.png'.format(i)), silce)
            #保存圖像
 
if __name__ == '__main__':
 filepath = 'nii的文件夾'
 imgfile = 'image的文件夾'
 nii_to_image(filepath)

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