BLAST中blastx和tblastn的區(qū)別有哪些

小億
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2023-08-03 15:44:34
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BLAST是一種常用的序列比對(duì)工具，用于比對(duì)蛋白質(zhì)和核酸序列。BLASTx和tBLASTn是BLAST工具中的兩種不同的搜索算法。

  1. BLASTx：BLASTx是將一個(gè)蛋白質(zhì)序列與一個(gè)核酸數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)。它將蛋白質(zhì)序列翻譯成所有可能的核酸序列（六種閱讀框），然后將這些序列與目標(biāo)核酸序列進(jìn)行比對(duì)。BLASTx常用于通過蛋白質(zhì)序列找到與其相似的核酸序列。

  2. tBLASTn：tBLASTn是將一個(gè)核酸序列與一個(gè)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)。它將目標(biāo)核酸序列進(jìn)行翻譯，得到所有可能的蛋白質(zhì)序列，然后將這些序列與蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)。tBLASTn常用于通過核酸序列找到與其相似的蛋白質(zhì)序列。

因此，BLASTx和tBLASTn的區(qū)別在于搜索的對(duì)象不同，BLASTx搜索蛋白質(zhì)序列與核酸數(shù)據(jù)庫的比對(duì)，而tBLASTn搜索核酸序列與蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫的比對(duì)。

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