tblastn和tblastx都是基于BLAST算法的工具,用于在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索與一個(gè)核酸序列相關(guān)的蛋白質(zhì)序列。
tblastn是在核酸序列上執(zhí)行的蛋白質(zhì)到蛋白質(zhì)的比對(duì)。它將輸入的核酸序列翻譯成六個(gè)可能的蛋白質(zhì)序列,然后與蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中的序列進(jìn)行比對(duì)。這種方法適用于在核酸序列中尋找蛋白質(zhì)編碼區(qū)域。
tblastx是在核酸序列上執(zhí)行的核酸到蛋白質(zhì)的比對(duì)。它將輸入的核酸序列轉(zhuǎn)換為六個(gè)可能的蛋白質(zhì)序列,并與蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中的序列進(jìn)行比對(duì)。與tblastn相比,tblastx能夠檢測(cè)到更多的序列相似性,因?yàn)樗紤]了核酸序列中的所有六種翻譯。
因此,tblastn適用于在核酸序列中尋找蛋白質(zhì)編碼區(qū)域,而tblastx適用于在核酸序列中尋找與蛋白質(zhì)序列相關(guān)的相似性。