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小編給大家分享一下python中如何處理圖片去除大塊黑色區(qū)域,相信大部分人都還不怎么了解,因此分享這篇文章給大家參考一下,希望大家閱讀完這篇文章后大有收獲,下面讓我們一起去了解一下吧!
在使用MEGAN軟件繪制分類學(xué)樹狀圖時(shí),如果物種較少,生成的圖片會有大片的黑色區(qū)域,很不美觀。
在使用MEGAN軟件繪制分類學(xué)樹狀圖時(shí),如果物種較少,生成的圖片會有大片的黑色區(qū)域,很不美觀。那怎樣去除呢,請看下面腳本:
腳本運(yùn)行命令:
python /share/work/wangq/script/work/png_black.py -i /share/nas1/fanyc/project/zx-20171030-47_21_ITS/2/ITS_3/4.Analysis_output/Taxa_summary/MEGAN_tree/Taxonomic_tree Usage: Options: -i <str> 分類學(xué)樹狀圖 png圖片所在目錄,也是輸出目錄(目錄最后不要帶"/") 程序檢索目錄下所有png文件并處理,輸出圖片會覆蓋原來的圖片
腳本代碼:
import numpy import sys, os, argparse, os.path,re,math from PIL import Image import matplotlib.pyplot as plt ############################################## parser = argparse.ArgumentParser(description='This script is used to an error_bar') parser.add_argument('-i','--in_dir',help='Please input in_dir directory path',required=True) args = parser.parse_args() pathDir = os.listdir(args.in_dir) for allDir in pathDir: if (re.search(r'png$',allDir)): child = os.path.join('%s/%s' % (args.in_dir, allDir)) img = Image.open(child) # Imgur's naming scheme pix = numpy.array(img) # Convert to array black = numpy.array([0,0,0]) white = numpy.array([255,255,255]) black1 = numpy.array([0,0,0,255]) white1 = numpy.array([255,255,255,255]) #print pix print pix[1,1] pix2 = pix.copy() dim = pix.shape #print pix[1,:]==black if (dim[2] == 3): for n in xrange(dim[0]): if (pix[n,:]==black).all(): pix2[n,:,numpy.newaxis] = white continue if ((pix[n,:]==black).sum()>=2.7*dim[1]): x = 0 for m in xrange(dim[1]): if (pix[n,m,:]==black).all(): x = x+1 if (x >= dim[1]*0.9): pix2[n,:,numpy.newaxis] = white # for n in xrange(dim[1]): # if (pix[:,n]==black).all(): # pix2[:,n,numpy.newaxis] = white if (dim[2] == 4): for n in xrange(dim[0]): if (pix[n,:]==black1).all(): pix2[n,:,numpy.newaxis] = white1 continue if ((pix[n,:]==black1).sum()>=3.7*dim[1]): x = 0 for m in xrange(dim[1]): if (pix[n,m,:]==black1).all(): x = x+1 if (x >= dim[1]*0.9): pix2[n,:,numpy.newaxis] = white1 # for n in xrange(dim[1]): # if (pix[:,n]==black1).all(): # pix2[:,n,numpy.newaxis] = white1 fig = plt.figure() ax = fig.add_axes([0.0, 0.0, 1.0, 1.0], frameon=False, aspect=1) ax.imshow(pix2) ax.set_xticks([]) ax.set_yticks([]) plt.savefig(child,dpi=600) plt.close() #.all() .all()
以上是“python中如何處理圖片去除大塊黑色區(qū)域”這篇文章的所有內(nèi)容,感謝各位的閱讀!相信大家都有了一定的了解,希望分享的內(nèi)容對大家有所幫助,如果還想學(xué)習(xí)更多知識,歡迎關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道!
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