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R語言中的函數(shù)調(diào)用報(bào)錯(cuò),一般不是很精確,很難查找到出錯(cuò)的具體原因。但是在R中可以采用traceback 進(jìn)行初步的判斷。
以下是一個(gè)示例:在運(yùn)行g(shù)dcCEAnalysis 這個(gè)函數(shù)時(shí),報(bào)錯(cuò)“names' attribute [11055] must be the same length as the vector [2777]” ,你根本不知道是什么原因?qū)е逻@個(gè)錯(cuò)誤。采用traceback函數(shù)之后,就會(huì)顯示函數(shù)運(yùn)行時(shí)具體到哪一步存在問題。
> ceOutput <- gdcCEAnalysis(lnc = rownames(deLNC), + pc = rownames(dePC), + lnc.targets = lnc_miRNA_Targets, + pc.targets = gene_miRNA_Targets, + rna.expr = rnaExpr, + mir.expr = mirExpr) Error in attributes(.Data) <- c(attributes(.Data), attrib) : 'names' attribute [11055] must be the same length as the vector [2777] > traceback() 5: structure(res, levels = lv, names = nm, class = "factor") 4: unlist(pc.targets) 3: unique(unlist(pc.targets)) 2: hyperTestFun(lnc, pc, deMIR, lnc.targets = lnc.targets, pc.targets = pc.targets) 1: gdcCEAnalysis(lnc = rownames(deLNC), pc = rownames(dePC), lnc.targets = lnc_miRNA_Targets, pc.targets = gene_miRNA_Targets, rna.expr = rnaExpr, mir.expr = mirExpr)
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