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這篇文章主要講解了“基因別名alias轉(zhuǎn)換成官方symbol的方法”，文中的講解內(nèi)容簡單清晰，易于學(xué)習(xí)與理解，下面請大家跟著小編的思路慢慢深入，一起來研究和學(xué)習(xí)“基因別名alias轉(zhuǎn)換成官方symbol的方法”吧！
limma包提供 alias2Symbol 可以將部分物種基因的別名，通過NCBI EntrezID轉(zhuǎn)換成官方的gene symbol
譬如：以人的 AP2基因為例：
> alias2Symbol(c("AP2"),species = "Hs",expand.symbols = F)
[1] "GTF3A"支持多alias同時轉(zhuǎn)換。修改數(shù)組向量元素即可。
轉(zhuǎn)換過程將依賴對應(yīng)的org包，需要提前進(jìn)行安裝：
| Package | Species | |
| org.Ag.eg.db | Anopheles | |
| org.Bt.eg.db | Bovine | |
| org.Ce.eg.db | Worm | |
| org.Cf.eg.db | Canine | |
| org.Dm.eg.db | Fly | |
| org.Dr.eg.db | Zebrafish | |
| org.EcK12.eg.db | E coli strain K12 | |
| org.EcSakai.eg.db | E coli strain Sakai | |
| org.Gg.eg.db | Chicken | |
| org.Hs.eg.db | Human | |
| org.Mm.eg.db | Mouse | |
| org.Mmu.eg.db | Rhesus | |
| org.Pt.eg.db | Chimp | |
| org.Rn.eg.db | Rat | |
| org.Ss.eg.db | Pig | |
| org.Xl.eg.db | Xenopus |
感謝各位的閱讀，以上就是“基因別名alias轉(zhuǎn)換成官方symbol的方法”的內(nèi)容了，經(jīng)過本文的學(xué)習(xí)后，相信大家對基因別名alias轉(zhuǎn)換成官方symbol的方法這一問題有了更深刻的體會，具體使用情況還需要大家實踐驗證。這里是億速云，小編將為大家推送更多相關(guān)知識點的文章，歡迎關(guān)注！
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