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這篇文章主要介紹了blastall中的文件格式有哪些的相關(guān)知識，內(nèi)容詳細易懂，操作簡單快捷，具有一定借鑒價值，相信大家閱讀完這篇blastall中的文件格式有哪些文章都會有所收獲，下面我們一起來看看吧。
1、Query id：查詢序列ID標(biāo)識
2、Subject id：比對上的目標(biāo)序列ID標(biāo)識
3、% identity：序列比對的一致性百分比
4、alignment length：符合比對的比對區(qū)域的長度
5、mismatches：比對區(qū)域的錯配數(shù)
6、gap openings：比對區(qū)域的gap數(shù)目
7、q. start：比對區(qū)域在查詢序列(Query id)上的起始位點
8、q. end：比對區(qū)域在查詢序列(Query id)上的終止位點
9、s. start：比對區(qū)域在目標(biāo)序列(Subject id)上的起始位點
10、s. end：比對區(qū)域在目標(biāo)序列(Subject id)上的終止位點
11、e-value：比對結(jié)果的期望值，解釋是大概多少次隨即比對才能出現(xiàn)一次這個score,Evalue越小，表明這種情況從概率上越不可能發(fā)生，那么發(fā)生了即說明這更有可能是真實的相似序列
12、bit score：比對結(jié)果的bit score值
一般情況我們看第3、11、12兩列，e值越小越可靠。
blast對應(yīng)的參數(shù)是 -m 8
blast+對應(yīng)的參數(shù)是-outfmt 6
關(guān)于“blastall中的文件格式有哪些”這篇文章的內(nèi)容就介紹到這里，感謝各位的閱讀！相信大家對“blastall中的文件格式有哪些”知識都有一定的了解，大家如果還想學(xué)習(xí)更多知識，歡迎關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道。
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