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這篇文章主要介紹“R語(yǔ)言中怎么使用dplyr軟件包來(lái)清理和轉(zhuǎn)換數(shù)據(jù)”的相關(guān)知識(shí),小編通過(guò)實(shí)際案例向大家展示操作過(guò)程,操作方法簡(jiǎn)單快捷,實(shí)用性強(qiáng),希望這篇“R語(yǔ)言中怎么使用dplyr軟件包來(lái)清理和轉(zhuǎn)換數(shù)據(jù)”文章能幫助大家解決問(wèn)題。
dplyr軟件包是R中功能最強(qiáng)大,最受歡迎的軟件包之一。該軟件包由最受歡迎的R程序員Hadley Wickham編寫(xiě),他編寫(xiě)了許多有用的R軟件包,如ggplot2,tidyr等。
dplyr是一個(gè)強(qiáng)大的R軟件包,用于處理,清理和匯總非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)。簡(jiǎn)而言之,它使得R中的數(shù)據(jù)探索和數(shù)據(jù)操作變得簡(jiǎn)單快捷。
軟件包“dplyr”包含許多主要使用的數(shù)據(jù)操作功能,例如應(yīng)用過(guò)濾器,選擇特定列,排序數(shù)據(jù),添加或刪除列以及聚合數(shù)據(jù)。這個(gè)包的另一個(gè)最重要的優(yōu)點(diǎn)是學(xué)習(xí)和使用dplyr函數(shù)非常容易。也很容易回想起這些功能。例如,filter()用于過(guò)濾行。dplyr函數(shù)處理速度比基本R函數(shù)快。 這是因?yàn)閐plyr函數(shù)是以計(jì)算有效的方式編寫(xiě)的。 它們?cè)谡Z(yǔ)法上也更穩(wěn)定,并且比向量更好地支持?jǐn)?shù)據(jù)幀。以下是該包中的方法與用途:
dplyr Function | Description | Equivalent SQL |
select() | Selecting columns (variables) | SELECT |
filter() | Filter (subset) rows. | WHERE |
group_by() | Group the data | GROUP BY |
summarise() | Summarise (or aggregate) data | - |
arrange() | Sort the data | ORDER BY |
join() | Joining data frames (tables) | JOIN |
mutate() | Creating New Variables | COLUMN ALIAS |
#安裝與加載包 #直接使用內(nèi)置的iris、mtcars數(shù)據(jù)集來(lái)演示 #iris數(shù)據(jù)集中,篩選Species為“setosa”,并且Sepal.Length大于5的樣本 #"&"也可以替換成“,” > filter(iris, Species == "setosa" & Sepal.Length >= 5.5) Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species 1 5.8 4.0 1.2 0.2 setosa 2 5.7 4.4 1.5 0.4 setosa 3 5.7 3.8 1.7 0.3 setosa 4 5.5 4.2 1.4 0.2 setosa 5 5.5 3.5 1.3 0.2 setosa
filter支持以下幾種判斷形式:
關(guān)系類(lèi)型:<、 <= 、 >、 >=、==、!=、is.na()、 !is.na()
&、 |、 !、 xor() #針對(duì)向量集的操作判斷
between()、%in%、 near() #sqrt(2) ^ 2 == 2 返回FALSE,near(sqrt(2) ^ 2, 2)則TRUE
all_vars()、any_vars() #出現(xiàn)于filter_all、filter_at、filter_if中,作為判斷條件
filter系列,還有幾個(gè)變異函數(shù):filter_all、filter_at、filter_if
#篩選任何變量>150的樣本 filter_all(mtcars, any_vars(. > 150)) #篩選變量以“d”結(jié)尾,并且變量 "%%2" 等于0 filter_at(mtcars, vars(starts_with("d")), any_vars((. %% 2) == 0)) # 篩選變量向下取整 == 原變量數(shù)值, 并且這部分變量的數(shù)值!= 0 的樣本集 filter_if(mtcars, ~ all(floor(.) == .), all_vars(. != 0))
更多用法:
mtcars %>% filter_all(all_vars(.>150)) %>% head() # 篩選所有變量均大于150的行,結(jié)果為空 mtcars %>% filter_all(any_vars(.>150)) %>% head() # 篩選存在變量大于150的行, # 針對(duì)變量名稱為d開(kāi)頭的所有列,篩選存在變量能整除2的所有行 mtcars %>% filter_at(vars(starts_with("d")), any_vars((.%% 2) == 0)) # 針對(duì)變量全為整數(shù)的列,篩選所有變量非0的所有行 mtcars %>% filter_if(~all(floor(.) == .), all_vars(.!= 0)) # 支持purrr語(yǔ)法篩選 mtcars %>% filter_at(vars(hp, vs), ~ .%% 2 == 0) # 篩選hp和vs變量都是偶數(shù)的所有行
用法:select(.data, …)
與之前講解的filter有所不同,select是篩選變量的,而filter是篩選樣本集。
應(yīng)用場(chǎng)景:假設(shè)數(shù)據(jù)存于寬表中(比如有100個(gè)變量的表),而你僅需要其中幾個(gè)變量。而select的關(guān)鍵在于”…“的判斷條件
#mtcars數(shù)據(jù)集中,篩選mpg、cyl、wt、vs,4個(gè)變量數(shù)據(jù) # mtcars[,c("mpg","cyl","wt","vs")],可以實(shí)現(xiàn)相同的功能 >select(mtcars,c("mpg","cyl","wt","vs")) mpg cyl wt vs 21.0 6 2.620 0 21.0 6 2.875 0 22.8 4 2.320 1 # Tips:select 同樣支持":"與"-"操作 # 比如:select(mtcars,c("mpg":"vs"))、表示連續(xù)的列選擇 # select(mtcars,-"mpg") 刪除mpg列
以上給人感覺(jué),不通過(guò)select,利用數(shù)據(jù)框與向量操作,同樣可以做到,select 真正強(qiáng)大的地方在于,支持以下幾種條件判斷:
包含關(guān)系:starts_with()、 ends_with()、 one_of()
匹配關(guān)系:matches()、contains()、num_range()
# 包含關(guān)系:在Iris中,篩選以Petal開(kāi)頭,或Width結(jié)尾的變量 >select(iris, starts_with("Petal"), ends_with("Width")) # Petal.Length Petal.Width Sepal.Width # 1.4 0.2 3.5 # 1.4 0.2 3.0 # 1.3 0.2 3.2 # ...(數(shù)據(jù)省略) # Tips:starts_with("Petal"), ends_with("Width"),2個(gè)條件不是 "且" 的關(guān)系,而是 "或" # 包含關(guān)系:經(jīng)常需要提取變化的數(shù)據(jù)集合,利用one_of再合適不過(guò)了 # 提取mtcars中,"mpg","cyl","wt","vs" ,"vss" >var1 <- c("mpg","cyl","wt","vs","vss") >select (mtcars, one_of(var1)) # mpg cyl wt vs # 21.0 6 2.620 0 # 21.0 6 2.875 0 # 2.8 4 2.320 1 # ...(省略數(shù)據(jù)) # Warning message: Unknown columns: `vss` # Tips: select沒(méi)找到額變量,系統(tǒng)會(huì)返回警告 # 匹配關(guān)系:篩選Iris數(shù)據(jù)集,變量名中帶有"wid"的變量名 >select(iris, matches(".wid.")) >select(iris, contains("wid")) # Sepal.Width Petal.Width # 3.5 0.2 # 3.0 0.2 # num_range能高效匹配變量名稱類(lèi)似x01, x02, x03的 # 隨機(jī)數(shù)據(jù)框,由X1~X5,y 組成: df <- data.frame(x1= runif(10), x2= runif(10), x3= runif(10), x4= runif(10), x5= runif(10), y= letters[1:10]) # 篩選 y, x1:x3的變量,并且把y重命名為 var1 >select(df, c(var1 = "y", num_range("x", 1:3))) # var1 x1 x2 x3 # a 0.96631605 0.29815009 0.6545414 # b 0.61046600 0.76547552 0.8247191 # c 0.70510879 0.46636723 0.4472588 # ... (數(shù)據(jù)省略)
用法:mutate(.data, …)
mutate的使用方式,主要是依靠"…"的公式變化,生成新的變量
mutate支持以下幾種公式 :
+、-、*、÷ 、%%、%|% 等常用計(jì)算方式
lead()、 lag()
dense_rank(), min_rank(), percent_rank(), row_number(), cume_dist(), ntile()
cumsum(), cummean(), cummin(), cummax(), cumany(), cumall()
na_if(), coalesce()
if_else(), recode(), case_when()
先從"rank"系列開(kāi)始介紹,這一函數(shù)類(lèi),主要是用來(lái)劃分名次、等級(jí)、百分比、密度等等
#############簡(jiǎn)單的+、-、*、÷ 、%%、%|% 可以增加新的數(shù)據(jù)列 >mutate(mtcars,aa=hp-drat,bb=mpg*cyl) mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb aa bb 1 21.0 6 160.0 110 3.90 2.620 16.46 0 1 4 4 106.10 126.0 2 21.0 6 160.0 110 3.90 2.875 17.02 0 1 4 4 106.10 126.0 3 22.8 4 108.0 93 3.85 2.320 18.61 1 1 4 1 89.15 91.2 4 21.4 6 258.0 110 3.08 3.215 19.44 1 0 3 1 106.92 128.4 5 18.7 8 360.0 175 3.15 3.440 17.02 0 0 3 2 171.85 149.6 6 18.1 6 225.0 105 2.76 3.460 20.22 1 0 3 1 102.24 108.6 7 14.3 8 360.0 245 3.21 3.570 15.84 0 0 3 4 241.79 114.4 #######如果只想保留這些新的變量可以: > transmute(mtcars,aa=hp-drat,bb=mpg*cyl) aa bb 1 106.10 126.0 2 106.10 126.0 3 89.15 91.2 4 106.92 128.4 5 171.85 149.6 6 102.24 108.6 ##########percent_rank,按照[0,1]百分比的形式進(jìn)行排序 # 舉例說(shuō)明,按照x的數(shù)值,按照百分比進(jìn)行劃分 x <- c(5, 1, 3, 2, 4) percent_rank(x) # [1] 1.00 0.00 0.50 0.25 0.75 # 這類(lèi)函數(shù)比較適用于 ,需要排名次的場(chǎng)景。比如考試、比賽... # 比如根據(jù)iris中的Sepal.Length,進(jìn)行百分比表示, 其中 %>% 管道的標(biāo)識(shí)符,select函數(shù)中,everything()可以用來(lái)更換變量順序 >iris %>% mutate(Length_rank = percent_rank(Sepal.Length)) %>% select(Length_rank,everything()) # Length_rank Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species # 0.21476510 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa # 0.10738255 4.9 3.0 1.4 0.2 setosa # ...(數(shù)據(jù)省略) # row_number(),不僅可以用來(lái)對(duì)想來(lái)排序,也可以表示獲取行數(shù) mutate(mtcars, row_number() == 1L) # 新生成的變量,用來(lái)判斷是否是第一行,返回TRUE 或者 FALSE mtcars %>% filter(between(row_number(), 1, 10)) # 通過(guò)row_number,篩選1-10行.有點(diǎn)類(lèi)似 top_n(10) # ntile,切割數(shù)據(jù)集為N塊,返回具體的數(shù)值,屬于等分切割 ntile(runif(10), 5) # [1] 1 2 4 5 5 3 4 2 3 1 # 某種程度上,ntile可以用來(lái)劃分訓(xùn)練集和測(cè)試集(類(lèi)似sample函數(shù)) # ind <- sample(2, nrow(mtcars), replace = TRUE, prob = c(0.8,0.2)) # mtcars[ind == 1,] # 備注:ntile對(duì)數(shù)據(jù)框使用的時(shí)候,如果沒(méi)有特殊標(biāo)明具體的數(shù)據(jù)列,ntile會(huì)對(duì)所有的列進(jìn)行切割操作
再說(shuō)一下"cum"函數(shù)系列,這類(lèi)函數(shù)計(jì)算累積指標(biāo),比如截止到某一天的平均值、總和、乘積等等。
# cumsum,累積相加的數(shù)值 cumsum(1:10) # 1 3 6 10 15 21 28 36 45 55 # 原數(shù)據(jù)集有N個(gè),返回也是N個(gè) # 類(lèi)似MS_SQL中的sum(s)over(order by y) # cumany(), cumall(),則是邏輯判斷,并非計(jì)算數(shù)值 cumall(-5:5) # TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE # 返回的是邏輯值,0代表FALSE
最后說(shuō)一下"判斷"函數(shù)系列,這類(lèi)函數(shù)應(yīng)用比較廣泛。
比如生活中,當(dāng)天空下雨了,小明就打傘了
類(lèi)似EXCEL中的 if函數(shù),vlookup函數(shù)等等
# if_else # 用法:if_else(condition, true, false, missing = NULL),比傳統(tǒng)的ifelse多了一個(gè)missing參數(shù) # 并且if_else能保留原數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)類(lèi)型,不會(huì)降維操作 # 假設(shè)x >= 0,則 y-1,y < 0 的情況下, y + 1 df <- data.frame(x = c(-5:4), y = runif(10)) df %>% mutate( xy = if_else(x >= 0, y -1, y+1, y)) # x y xy # -5 0.7760150 1.7760150 # -4 0.9310976 1.9310976 # case_when中,判斷的條件可以更加的多樣化 # case_when,與SQL中的case...when...一樣 # 同C語(yǔ)言中的switch一樣 x <- c(1:10,NA) case_when( x %% 2 == 0 ~ "偶", x %% 2 == 1 ~ "奇", TRUE ~ as.character(x) #可以設(shè)置一個(gè)默認(rèn)值 ) "奇" "偶" "奇" "偶" "奇" "偶" "奇" "偶" "奇" "偶" NA
arrange() 函數(shù)以行為單位進(jìn)行排序,默認(rèn)為升序排列,降序使用 desc( ) 函數(shù)。第一個(gè)參數(shù)為數(shù)據(jù)集名稱,后面為排序依據(jù)變量。
> arrange(mtcars,hp,mpg,cyl ) mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb 1 30.4 4 75.7 52 4.93 1.615 18.52 1 1 4 2 2 24.4 4 146.7 62 3.69 3.190 20.00 1 0 4 2 3 33.9 4 71.1 65 4.22 1.835 19.90 1 1 4 1 4 27.3 4 79.0 66 4.08 1.935 18.90 1 1 4 1 5 32.4 4 78.7 66 4.08 2.200 19.47 1 1 4 1 6 26.0 4 120.3 91 4.43 2.140 16.70 0 1 5 2 7 22.8 4 108.0 93 3.85 2.320 18.61 1 1 4 1 8 22.8 4 140.8 95 3.92 3.150 22.90 1 0 4 2 9 21.5 4 120.1 97 3.70 2.465 20.01 1 0 3 1 10 18.1 6 225.0 105 2.76 3.460 20.22 1 0 3 1
多列排序,降序用desc()
> arrange(mtcars,desc(hp),mpg,cyl ) mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb 1 15.0 8 301.0 335 3.54 3.570 14.60 0 1 5 8 2 15.8 8 351.0 264 4.22 3.170 14.50 0 1 5 4 3 13.3 8 350.0 245 3.73 3.840 15.41 0 0 3 4 4 14.3 8 360.0 245 3.21 3.570 15.84 0 0 3 4 5 14.7 8 440.0 230 3.23 5.345 17.42 0 0 3 4 6 10.4 8 460.0 215 3.00 5.424 17.82 0 0 3 4 7 10.4 8 472.0 205 2.93 5.250 17.98 0 0 3 4 8 15.2 8 275.8 180 3.07 3.780 18.00 0 0 3 3 9 16.4 8 275.8 180 3.07 4.070 17.40 0 0 3 3 10 17.3 8 275.8 180 3.07 3.730 17.60 0 0 3 3
sample_n() and sample_frac() 分別是按固定多少行隨機(jī)選取,一個(gè)是按行數(shù)的比例選?。?/p>
> sample_n(mtcars,10) mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb 1 18.7 8 360.0 175 3.15 3.440 17.02 0 0 3 2 2 14.3 8 360.0 245 3.21 3.570 15.84 0 0 3 4 3 21.5 4 120.1 97 3.70 2.465 20.01 1 0 3 1 4 32.4 4 78.7 66 4.08 2.200 19.47 1 1 4 1 5 26.0 4 120.3 91 4.43 2.140 16.70 0 1 5 2 6 19.2 6 167.6 123 3.92 3.440 18.30 1 0 4 4 7 17.8 6 167.6 123 3.92 3.440 18.90 1 0 4 4 8 27.3 4 79.0 66 4.08 1.935 18.90 1 1 4 1 9 15.8 8 351.0 264 4.22 3.170 14.50 0 1 5 4 10 15.5 8 318.0 150 2.76 3.520 16.87 0 0 3 2 > sample_frac(mtcars,0.1) mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb 1 10.4 8 472 205 2.93 5.25 17.98 0 0 3 4 2 14.3 8 360 245 3.21 3.57 15.84 0 0 3 4 3 13.3 8 350 245 3.73 3.84 15.41 0 0 3 4
data(iris) data(mtcars) iris %>% head() mtcars %>% head() # 篩選變量名為字符串開(kāi)頭的變量 iris %>% select(starts_with("Sepal")) %>% head() # 多個(gè)篩選條件 iris %>% select(-starts_with("Sepal")) %>% head() # 篩選變量名為字符串結(jié)尾的變量 iris %>% select(ends_with("Length")) %>% head() iris %>% select(-ends_with("Length")) %>% head() # 將變量Species移動(dòng)到最前面 iris %>% select(Species, everything()) %>% head() # 反篩選,篩選除了Sepal.Length變量的其它變量 iris %>% select(-Sepal.Length) %>%head() # 將變量Species移動(dòng)到最后面 iris %>% select(everything(), Species) %>% head() iris %>% select(-Species, Species) %>% head() # 錯(cuò)誤的用法,結(jié)果為空 iris %>% select(Species, -Species) %>% head() iris %>% select(contains("etal")) %>% head() iris %>% select(matches(".t.")) %>% head() # 篩選名稱中,t在中間的變量。 iris %>% select(last_col()) %>% head()# 最后一個(gè)變量 iris %>% select(last_col(offset = 2)) %>% head() # 倒數(shù)第3個(gè)變量 iris %>% select(one_of(c("Petal.Length", "Petal.Width"))) %>% head() iris %>% group_by(Species) %>% select(group_cols()) %>% distinct() %>% head() # 獲取分組變量名 df <- as.data.frame(matrix(runif(100), nrow = 10)) %>% as_tibble() head(df) df %>% select(V4:V7) %>% head() # 篩選V4列到V7列 df %>% select(num_range("V", 4:7)) %>% head() # 結(jié)果與前面一樣 #列名重命名 iris %>% select(petal_length = Petal.Length) %>% head() # 重命名 iris %>% select(obs = starts_with('S')) %>% head() # 多個(gè)變量重命名
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