GSDS網(wǎng)站docker鏡像本地構(gòu)建的示例分析

這篇文章主要介紹GSDS網(wǎng)站docker鏡像本地構(gòu)建的示例分析，文中介紹的非常詳細(xì)，具有一定的參考價(jià)值，感興趣的小伙伴們一定要看完！

GSDS網(wǎng)站docker鏡像本地構(gòu)建

GSDS網(wǎng)站有時(shí)候打不開(kāi)，可能服務(wù)器沒(méi)有人維護(hù)，原網(wǎng)站：http://gsds.cbi.pku.edu.cn/index.php   備用網(wǎng)站：http://gsds.gao-lab.org/index.php 

這里為了方便大家使用GSDS，繪制基因結(jié)構(gòu)圖，組學(xué)大講堂免費(fèi)提供一個(gè)鏡像使大家可以在自己的電腦上搭建一個(gè)GSDS網(wǎng)站，這樣就永遠(yuǎn)不會(huì)打不開(kāi)網(wǎng)站了，具體方法如下：

搭建網(wǎng)站系統(tǒng)環(huán)境：
操作系統(tǒng)：win10教育版，
docker：docker桌面版本

1.下載組學(xué)大講堂提供的專門(mén)為GSDS定制的docker鏡像

> docker search omicsclass   #搜索鏡像
NAME                           DESCRIPTION                                     STARS               OFFICIAL            AUTOMATED
omicsclass/gene-family         gene-family analysis docker image               4
omicsclass/rnaseq              RNA-seq analysis docker image build by omics…   3
omicsclass/reseq               whole genome resequence analysis                1
omicsclass/blast-plus          blast+ v2.9.0                                   0
omicsclass/biocontainer-base   Biocontainers base Image centos7                0
omicsclass/isoseq3             isoseq3 v3.3.0 build by omicsclass              0
omicsclass/bwa                 BWA v0.7.17 build by omicsclass                 0
omicsclass/samtools            samtools v1.10 build by omicsclass              0
omicsclass/blastall            legacy blastall v2.2.26                         0
omicsclass/sratoolkit          SRAtoolkit v2.10.3 and aspera v3.9.9.177872     0
omicsclass/ampliseq-q2         Amplicon sequencing qiime2 v2020.2 image        0
omicsclass/bsaseq              NGS Bulk Segregant Analysis image               0
omicsclass/ampliseq-q1         Amplicon sequencing qiime1 v1.9.1 image         0
omicsclass/gwas                gwas analysis images                            0

> docker pull omicsclass/gsds-v2  #下載鏡像

2.下載GSDS網(wǎng)站源代碼下載：gsds_v2.zip  ，然后解壓文件到一個(gè)目錄：

我這里解壓到了：D:\gsds_v2

3.啟動(dòng)docker鏡像：

>     #查看后臺(tái)鏡像
REPOSITORY               TAG                 IMAGE ID            CREATED             SIZE
omicsclass/gsds-v2       latest              d77e054c3744        8 hours ago         2.54GB
mattrayner/lamp          latest              05750cfa54d5        5 days ago          915MB
omicsclass/bsaseq        latest              d5ed7a70bfc8        13 days ago         9.77GB
omicsclass/reseq         v1.1                da154448a90f        4 weeks ago         8.83GB
omicsclass/gene-family   v1.0                2d1d640726dd        3 months ago        4.53GB
>          #后臺(tái)啟動(dòng)docker網(wǎng)站服務(wù)器，注意目錄映射-v 參數(shù)， 解壓的目錄D:\gsds_v2

4.打開(kāi)網(wǎng)站使用本地GSDS網(wǎng)站：

網(wǎng)站本地地址：127.0.0.1   ，如果網(wǎng)站沒(méi)有打開(kāi)，可以稍等一下，后臺(tái)服務(wù)啟動(dòng)需要時(shí)間；

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