R語(yǔ)言的tcga_gene_exp_download.r怎么用

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tcga_gene_exp_download.r  腳本幫助

使用方法：

usage: tcga_gene_exp_download.r [-h] -p project [-f files.per.chunk]
                                [-o outdir]
TCGA 基因表達(dá)數(shù)據(jù)下載及臨床數(shù)據(jù)下載與整理，詳細(xì)幫助見:https://www.億速云.com/article/1485
optional arguments:
  -h, --help            show this help message and exit
  -p project, --project project
                        input project ID of TCGA, for example TCGA-STAD,more
                        project ID:https://www.億速云.com/article/1061
                        [required]
  -f files.per.chunk, --files.per.chunk files.per.chunk
                        This will make the API method only download n
                        (files.per.chunk) files at a time. This may reduce the
                        download problems when the data size is too large
                        [default 10]
  -o outdir, --outdir outdir
                        output file directory [default cwd]

說(shuō)明：

下載使用的R包為：TCGAbiolinks    長(zhǎng)鏈非編碼基因數(shù)據(jù)：gencodev22

使用命令示例：

Rscript tcga_gene_exp_download.r -p TCGA-STAD

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