Rcpp和RcppArmadillo如何創(chuàng)建R語言包

小編給大家分享一下Rcpp和RcppArmadillo如何創(chuàng)建R語言包，相信大部分人都還不怎么了解，因此分享這篇文章給大家參考一下，希望大家閱讀完這篇文章后大有收獲，下面讓我們一起去了解一下吧！

1. 預(yù)先準(zhǔn)備

Windows下需要安裝Rtools，R中裝好Rcpp和RcppArmadillo。創(chuàng)建C++源文件func.cpp，自定義頭文件test_h.h。

源文件示例func.cpp

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
#include <RcppArmadillo.h>
#include <vector>
#include "./test_h.h"

using namespace Rcpp;
using namespace std;
// using namespace arma;

// [[Rcpp::export]]
RObject func(){
  arma::cube A(3,4,5,arma::fill::randu);
  std::cout<<CONDIT<<std::endl;
  return wrap(A);
}

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]：用于指明需要使用RcppArmadillo。

// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]：指明需要使用C++11。

#include "./test_h.h"：表示使用第三方頭文件。第三方頭文件需要用雙引號""包括起來，并加上.h。./表示在當(dāng)下文件夾(src)下搜尋文件。

// using namespace arma;不一定有用。如果要用Armadillo的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)，在其之前需指明arma::。

func()函數(shù)將可以直接在R中調(diào)用。

頭文件示例test_h.h

#include <iostream>
#define CONDIT 1000

2. 創(chuàng)建R包步驟

新建R Package

選擇Package w/Rcpp, 并添加源文件?；蛘呓院螅謩訌?fù)制到src文件夾下。

R包的文件結(jié)構(gòu)

修改DESCRIPTION文件

將RcppArmadillo添加進(jìn)Imports和LinkingTo中。

Package: RcppPackTest
Type: Package
Title: What the Package Does (Title Case)
Version: 0.1.0
Author: Who wrote it
Maintainer: The package maintainer <yourself@somewhere.net>
Description: More about what it does (maybe more than one line)
    Use four spaces when indenting paragraphs within the Description.
License: What license is it under?
Encoding: UTF-8
LazyData: true
Imports: Rcpp (>= 0.12.11), RcppArmadillo
LinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo

Build & Reload 建立包

3. C++11標(biāo)準(zhǔn)問題

如果要使用C++11標(biāo)準(zhǔn)，第一種方法是在Makevars文件中添加如下代碼：

CXX = g++-4.8.1
PKG_CXXFLAGS = -std=c++11

第二種方法是在.cpp文件前添加// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]

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