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WGCNA的TOM矩陣熱圖配色問題該怎么解決

發(fā)布時(shí)間：2021-12-08 15:03:29 來源：億速云 閱讀：299 作者：柒染 欄目：大數(shù)據(jù)

WGCNA的TOM矩陣熱圖配色問題該怎么解決，很多新手對(duì)此不是很清楚，為了幫助大家解決這個(gè)難題，下面小編將為大家詳細(xì)講解，有這方面需求的人可以來學(xué)習(xí)下，希望你能有所收獲。

“老米”投稿：手把手10分文章WGCNA復(fù)現(xiàn)：小膠質(zhì)細(xì)胞亞群在腦發(fā)育時(shí)髓鞘形成的作用 , 里面是有TOM矩陣熱圖，就是配色很奇怪。所以經(jīng)常有人詢問這個(gè)問題：

WGCNA的TOM矩陣熱圖配色問題該怎么解決

奇怪的配色

但是官網(wǎng)配色是：

WGCNA的TOM矩陣熱圖配色問題該怎么解決

官網(wǎng)配色

首先，這個(gè)差異其實(shí)并不重要，當(dāng)然了這個(gè)TOM矩陣熱圖本身就可有可無，僅僅是因?yàn)榻坛汤锾岬搅硕?，大部分情況下，就是湊圖。

再說，這個(gè)配色問題，跟WGCNA沒有關(guān)系，是R語言技巧罷了。或者說是搜索技巧：

  • https://www.biostars.org/p/394615/#394743

簡單的配色代碼即可解決：

TOMplot(plotTOM, geneTree, moduleColors, main = "Network heatmap plot, all genes", col=gplots::colorpanel(250,'red',"orange",'lemonchiffon')) 

看完上述內(nèi)容是否對(duì)您有幫助呢？如果還想對(duì)相關(guān)知識(shí)有進(jìn)一步的了解或閱讀更多相關(guān)文章，請(qǐng)關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道，感謝您對(duì)億速云的支持。

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