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DNA損傷修復(fù)基因數(shù)據(jù)庫的示例分析

發(fā)布時間:2022-01-17 09:42:42 來源:億速云 閱讀:223 作者:小新 欄目:大數(shù)據(jù)

小編給大家分享一下DNA損傷修復(fù)基因數(shù)據(jù)庫的示例分析,相信大部分人都還不怎么了解,因此分享這篇文章給大家參考一下,希望大家閱讀完這篇文章后大有收獲,下面讓我們一起去了解一下吧!

DNA損傷與修復(fù)是生命活動中的重要現(xiàn)象,據(jù)統(tǒng)計(jì),每個體細(xì)胞每天會受到至少六萬次的DNA損傷,正是由于DNA損傷修復(fù)機(jī)制的存在,才能夠隨時糾正和修復(fù)這些損傷,保證生命活動的正常進(jìn)行。

如果DNA損傷沒有被正確修復(fù),可能發(fā)生以下3種情況

  1. 細(xì)胞衰老,加速細(xì)胞衰老進(jìn)程

  2. 細(xì)胞凋亡,DNA損傷過度無法修復(fù)時,會啟動凋亡程序來清除損傷的細(xì)胞

  3. 細(xì)胞癌變,DNA損傷部分修復(fù)的情況下,細(xì)胞會出現(xiàn)各種基因組變異,累積到一定程度導(dǎo)致正常細(xì)胞癌變成為腫瘤細(xì)胞


DNA損傷與修復(fù)機(jī)制在維持正常生命活動和腫瘤發(fā)生發(fā)展中扮演重要角色,經(jīng)過科學(xué)家們堅(jiān)持不懈的努力,對于DNA損傷修復(fù)機(jī)制有了更加清晰的認(rèn)識,主要有以下幾種類別

1. BER

全稱為Basic excision repair,稱之為堿基切除修復(fù),由DNA糖基化酶啟動,識別缺失,錯配,烷基化等損傷類型,可以切除或者替換單個受損的堿基。

2. NER

全稱為nucleotide excision repair, 稱之為核苷酸切除修復(fù),識別異常的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu),針對連續(xù)多個堿基的受損進(jìn)行修復(fù)。

3. MMR

全稱為mismatch excision repair, 稱之為錯配切除修復(fù),用于修正各種原因?qū)е碌膲A基錯配,插入,缺失等DNA損傷。

4.  雙鏈斷裂修復(fù)

DNA雙鏈的斷裂會引起基因組的序列的丟失和重排,是最嚴(yán)重的的DNA損傷,主要通過同源重組修復(fù)HR和非同源末端鏈接修復(fù)NHEJ兩種方式來修復(fù)此類損傷。

oncotator在對腫瘤突變進(jìn)行注釋時,專門集成了一個損傷修復(fù)基因的數(shù)據(jù),將Wood RD等人在文章中提到的DNA損傷修復(fù)相關(guān)的基因進(jìn)行了匯總,網(wǎng)址如下

https://www.mdanderson.org/documents/Labs/Wood-Laboratory/human-dna-repair-genes.html

DNA損傷修復(fù)基因數(shù)據(jù)庫的示例分析

給出了對應(yīng)的基因名稱,類別,染色體位置等詳細(xì)信息,如果關(guān)注DNA損傷修復(fù)與腫瘤突變的關(guān)聯(lián),這個數(shù)據(jù)庫值得參考。

以上是“DNA損傷修復(fù)基因數(shù)據(jù)庫的示例分析”這篇文章的所有內(nèi)容,感謝各位的閱讀!相信大家都有了一定的了解,希望分享的內(nèi)容對大家有所幫助,如果還想學(xué)習(xí)更多知識,歡迎關(guān)注億速云行業(yè)資訊頻道!

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